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Familia de las crotonasas

La familia de las crotonasas comprende proteínas mecanísticamente diversas que comparten una estructura cuaternaria trimérica conservada (a veces un hexámero que consiste en un dímero de trímeros), cuyo núcleo consiste en 4 vueltas de una superhélice (beta/beta/alfa)n.

Se ha demostrado que algunas enzimas de la superfamilia presentan actividades de deshalogenasa , hidratasa e isomerasa , mientras que otras han sido implicadas en la formación y escisión de enlaces carbono-carbono, así como en la hidrólisis de tioésteres. [1] Sin embargo, estas diferentes enzimas comparten la necesidad de estabilizar un intermedio de anión enolato derivado de un sustrato acil-CoA . Esto se logra mediante dos grupos NH peptídicos conservados estructuralmente que proporcionan enlaces de hidrógeno a las fracciones carbonilo de los sustratos acil-CoA y forman un "agujero de oxianión". Los derivados de tioéster de CoA se unen en una forma característica de gancho y un túnel conservado une el grupo panteteína de CoA, que vincula el sitio de unión de ADP 3'-fosfato al sitio de reacción. [2] Las enzimas de la superfamilia de las crotonasas incluyen:

Proteínas humanas que contienen este dominio

AUH ; CDY2B; CDIL; CDIL2 ; ICD; ECH1 ; ECHDC1; ECHDC2; ECHDC3; ECHS1 ; EHHADH ; HADHA ; HCA64; HIBCH ; PECI ;

Referencias

  1. ^ Gerlt JA, Benning MM, Holden HM, Haller T (2001). "La superfamilia de las crotonasas: enzimas relacionadas de forma divergente que catalizan diferentes reacciones que involucran tioésteres de acil coenzima a". Acc. Chem. Res . 34 (2): 145–57. doi :10.1021/ar000053l. PMID  11263873.
  2. ^ Brzozowski AM, Leonard PM, Bennett JP, Whittingham JL, Grogan G (2007). "Caracterización estructural de una hidrolasa de beta-dicetona de la cianobacteria Anabaena sp. PCC 7120 en formas nativas y unidas a productos, un miembro independiente de la coenzima A de la suprafamilia de las crotonasas". Bioquímica . 46 (1): 137–44. doi :10.1021/bi061900g. PMID  17198383.
  3. ^ Wu J, Kisker C, Whitty A, Feng Y, Rudolph MJ, Bell AF, Hofstein HA, Parikh S, Tonge PJ (2002). "La estereoselectividad de la enoil-CoA hidratasa resulta de la activación preferencial de uno de los dos conformadores de sustrato unidos". Chem. Biol . 9 (11): 1247–55. doi : 10.1016/S1074-5521(02)00263-6 . PMID  12445775.
  4. ^ Stoffel W, Muller-Newen G (1991). "3-2trans-Enoyl-CoA isomerasa mitocondrial. Purificación, clonación, expresión e importación mitocondrial de la enzima clave de la beta-oxidación de ácidos grasos insaturados". Biol. Chem. Hoppe-Seyler . 372 (8): 613–624. doi :10.1515/bchm3.1991.372.2.613. PMID  1958319.
  5. ^ Dunaway-Mariano D, Benning MM, Wesenberg G, Holden HM, Taylor KL, Yang G, Liu RQ, Xiang H (1996). "Estructura de la 4-clorobenzoil coenzima A deshalogenasa determinada con una resolución de 1,8 A: un catalizador enzimático generado mediante mutación adaptativa". Bioquímica . 35 (25): 8103–9. doi :10.1021/bi960768p. PMID  8679561.
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  9. ^ Gerlt JA, Benning MM, Holden HM, Haller T (2000). "Nuevas reacciones en la superfamilia de las crotonasas: estructura de la metilmalonil CoA descarboxilasa de Escherichia coli". Bioquímica . 39 (16): 4630–9. doi :10.1021/bi9928896. PMID  10769118.
  10. ^ Schofield CJ, McDonough MA, Sleeman MC, Sorensen JL, Batchelar ET (2005). "Estudios estructurales y mecanísticos sobre la carboximetilprolina sintasa (CarB), un miembro único de la superfamilia de las crotonasas que cataliza el primer paso en la biosíntesis de carbapenémicos". J. Biol. Chem . 280 (41): 34956–65. doi : 10.1074/jbc.M507196200 . PMID:  16096274.
  11. ^ Leonard PM, Grogan G (2004). "Estructura del mutante 6-oxo alcanfor hidrolasa H122A unido a su producto natural, ácido (2S,4S)-alfa-canfolínico: la estructura del mutante sugiere un modo atípico de unión al estado de transición para un homólogo de crotonasa". J. Biol. Chem . 279 (30): 31312–17. doi : 10.1074/jbc.M403514200 . PMID  15138275.
  12. ^ Resibois-Gregoire A, Dourov N (1966). "Estudio con microscopio electrónico de un caso de glucogenosis cerebral". Acta Neuropathol . 6 (1): 70–9. doi :10.1007/BF00691083. PMID  5229654. S2CID  21331079.
  13. ^ Nureki O, Fukai S, Yokoyama S, Muto Y, Kurimoto K (2001). "Estructura cristalina de la proteína AUH humana, un homólogo de unión al ARN monocatenario de la enoil-CoA hidratasa". Structure . 9 (12): 1253–63. doi : 10.1016/S0969-2126(01)00686-4 . PMID  11738050.
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