La ARNasa R , o Ribonucleasa R, es una exorribonucleasa 3'-->5' , que pertenece a la superfamilia de las ARNasas II , un grupo de enzimas que hidrolizan el ARN en la dirección 3' - 5'. Se ha demostrado que la ARNasa R está involucrada en la degradación selectiva del ARNm , particularmente de los ARNm non-stop en bacterias. [1] [2] La ARNasa R tiene homólogos en muchos otros organismos.
Cuando una parte de otra proteína más grande tiene un dominio muy similar a la ARNasa R, esto se denomina dominio ARNasa R.
La ARNasa R garantiza la precisión de la traducción, la maduración correcta del ARNr y la eliminación de ARNr anormales, y es empleada por el sistema de trans -traducción para descomponer los ARNm dañados. [3]
En Escherichia coli , la ARNasa R es una proteína de 92 kD, con la capacidad característica de degradar sustratos de ARN estructurado sin mostrar especificidad de secuencia. Por lo tanto, la ARNasa R actúa sobre una variedad de sustratos, como el ARN ribosómico, el ARN de transferencia, el ARN mensajero y los ARN pequeños no codificantes. La ARNasa R está asociada con el complejo ribonucleoproteico que contiene ARNtm y SmpB, y está involucrada en el desarrollo del ARNtm bajo choque frío. [3]
La ARNasa R también está asociada con los ribosomas y participa en los procesos de control de calidad del ARNr o ARN ribosómico. La ARNasa R tiene una afinidad in vitro por el ARNr. En varias vías de control de calidad del ARNr, la ARNasa R se comporta como un factor principal al mejorar la eliminación de moléculas de ARNr defectuosas. Esta proteína también es fundamental para manipular los precursores del ARNr y para observar la integridad de los ribosomas. [3]
La ARNasa R tiene dos dominios de choque frío, un dominio catalítico de ARNasa, un dominio S1 y un dominio básico. [4]
La sobreabundancia de RNasa R en una célula es perjudicial, ya que la RNasa R es más activa y más eficaz en la descomposición de ARN que las otras exorribonucleasas bacterianas, como la RNasa II . [5] Además de los ARN sustrato que construyen ARN bicatenario con salientes 3' más cortos que siete nucleótidos, la RNasa R puede degradar todos los ARN lineales. [6] Para la digestión metódica de ARN lineales eucariotas, la RNasa R es una buena exorribonucleasa 3' a 5', pero hay casos poco frecuentes de resistencia a la RNasa R. Dado que los ARNm no están protegidos químicamente en sus extremos 3', a diferencia de la protección proporcionada en sus extremos 5' por la estructura de la tapa, la RNasa R degrada con éxito los ARNm lineales desde sus extremos 3' desprotegidos. [4]