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Medicina in silico

La medicina in silico (también conocida como " medicina computacional ") es la aplicación de la investigación in silico a problemas relacionados con la salud y la medicina. Es el uso directo de la simulación por computadora en el diagnóstico, tratamiento o prevención de una enfermedad . Más específicamente, la medicina in silico se caracteriza por el modelado , simulación y visualización de procesos biológicos y médicos en computadoras con el objetivo de simular procesos biológicos reales en un entorno virtual. [1]

Historia

El término in silico fue utilizado por primera vez en 1989 en un taller "Autómatas celulares: teoría y aplicaciones" por un matemático de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM). [2] El término in silico radiooncología , un precursor de la medicina in silico genérica, fue acuñado e introducido por primera vez por G. Stamatakos en Proceedings of the IEEE en 2002. [3] El mismo investigador acuñó e introdujo el término más genérico in silico oncología . [4] La medicina in silico se considera una extensión del trabajo previo que utiliza modelos matemáticos de sistemas biológicos. [4] Se hizo evidente que las técnicas utilizadas para modelar sistemas biológicos tienen utilidad para explicar y predecir la dinámica en el campo médico. Los primeros campos de la medicina en utilizar el modelado in silico fueron la genética, la fisiología y la bioquímica. El campo experimentó una afluencia dramática de datos cuando se secuenció el genoma humano en los años 1980 y 1990. Al mismo tiempo, el aumento de la potencia computacional disponible permitió modelar sistemas complejos que antes eran poco prácticos. [5]

Razón fundamental

Existen numerosas razones por las que se utiliza la medicina in silico . Por ejemplo, el modelado médico in silico puede permitir la predicción temprana del éxito de un compuesto para un propósito medicinal y dilucidar los posibles efectos adversos en las primeras etapas del proceso de descubrimiento de un fármaco . [6] El modelado in silico también puede proporcionar una alternativa humana a las pruebas con animales. [2] Una empresa del sector ha afirmado que los modelos asistidos por ordenador harán que el uso de pruebas en organismos vivos quede obsoleto. [7]

Ejemplos

El término medicina in silico se ejemplifica en iniciativas como el Virtual Physiological Human de la Comisión Europea [8] y en institutos como el VPH Institute y el INSIGNEO Institute de la Universidad de Sheffield.

El Grupo de Oncología In Silico (ISOG) [9] del Instituto de Sistemas de Comunicación e Informática del Instituto Técnico Nacional de Atenas (ICCS-NTUA) tiene como objetivo desarrollar modelos de simulación multiescala orientados y controlados clínicamente de tumores malignos (cáncer) para ser utilizados como sistemas de apoyo a la toma de decisiones individualizada del paciente y de planificación del tratamiento una vez completada la adaptación y validación clínicas. Un objetivo adicional de la investigación del Grupo es simular ensayos clínicos oncológicos que de otro modo serían demasiado costosos o requerirían demasiado tiempo y, en esta dirección, se han explotado infraestructuras de computación en red , como la Infraestructura de Red Europea , para aumentar el rendimiento y la eficacia de las simulaciones. [10] ISOG ha liderado el desarrollo del primer Oncosimulator tecnológicamente integrado , una iniciativa de investigación conjunta eurojaponesa. [11]

En 2003 se desarrolló la primera vacuna basada únicamente en información genómica. La técnica de desarrollo de la vacuna, denominada "vacunología inversa", utilizó la información genómica y no la bacteria infecciosa en sí para desarrollar la vacuna. [12]

En diciembre de 2018 se puso en marcha el proyecto PRIMAGE, de cuatro años de duración. Este proyecto financiado por la UE en el marco del programa Horizonte 2020 propone una plataforma basada en la nube para respaldar la toma de decisiones en el tratamiento clínico de tumores sólidos malignos, ofreciendo herramientas predictivas para ayudar en el diagnóstico, el pronóstico, la elección de terapias y el seguimiento del tratamiento, basándose en el uso de nuevos biomarcadores de imagen, simulación del crecimiento tumoral in silico, visualización avanzada de predicciones con puntuaciones de confianza ponderadas y traducción de este conocimiento basada en aprendizaje automático en predictores de los puntos finales clínicos más relevantes y específicos de la enfermedad. [13] [14]

En 2020 se celebró la primera Conferencia Médica CADFEM sobre el tema in vivo, in vitro, in silico con el tema rector: "El papel central de la medicina in silico: lo que puede hacer y lo que necesitamos para su práctica". [15]

Investigación

A medida que el modelado de las características humanas, sociales, conductuales y culturales (HSBC) del comportamiento de los pacientes se vuelve más sofisticado, se especula que los pacientes virtuales pueden reemplazar a los actores pacientes en el plan de estudios de las escuelas de medicina. Además, hay proyectos en marcha que utilizan cadáveres virtuales, modelos simulados por computadora de la anatomía humana basados ​​en imágenes de TC de personas reales. [16]

Véase también

Referencias

  1. ^ "Historias de éxito del proyecto: la medicina in silico llega a la clínica". Comisión Europea CORDIS . Consultado el 9 de noviembre de 2017 .
  2. ^ ab "Métodos In Silico | ORQUESTA". Archivado desde el original el 13 de abril de 2014. Consultado el 10 de abril de 2014 .
  3. ^ G. Stamatakos; D. Dionysiou; E. Zacharaki; N. Mouravliansky; K. Nikita; N. Uzunoglu (2002). "Oncología radioterápica in silico: combinación de nuevos algoritmos de simulación con técnicas de visualización actuales". Actas del IEEE . 90 (11): 1764–1777. doi :10.1109/JPROC.2002.804685.
  4. ^ ab Stamatakos, Georgios (2006). "Enfoque en la informática del cáncer". Informática del cáncer (2): 83–86. doi :10.1177/117693510600200029. PMC 2675506. PMID  19458760 . 
  5. ^ Schneider, Maria Victoria (2013). Biología de sistemas in silico . Métodos en biología molecular. Vol. 1021. Métodos en biología molecular. pp. Capítulo 1. doi :10.1007/978-1-62703-450-0. ISBN 978-1-62703-449-4. Número de identificación del sujeto  3690704.
  6. ^ Ahmet, Ahmet; Sean, Ekins; Sandhya, Kortagere (8 de enero de 2012). "Aplicaciones y limitaciones de los modelos in silico en el descubrimiento de fármacos". Bioinformática y descubrimiento de fármacos . 910 : 87–124. doi :10.1007/978-1-61779-965-5_6.
  7. ^ "Mejorar el bienestar de los animales: los investigadores desarrollan modelos asistidos por ordenador para sustituir la experimentación con animales". 4 de octubre de 2013. Archivado desde el original el 4 de marzo de 2016.
  8. ^ "El Séptimo Programa Marco (7PM)". 7PM Comisión Europea . Consultado el 10 de mayo de 2013 .
  9. ^ "In Silico Oncology and In Silico Medicine Group". in-silico-oncology.iccs.ntua.gr . 2014-04-10. Archivado desde el original el 2018-10-15.
  10. ^ Athanaileas, Theodoros; et al. (2011). "Explotación de tecnologías de cuadrícula para la simulación de ensayos clínicos: el paradigma de la oncología radioterapéutica in silico". SIMULACIÓN: Transacciones de la Sociedad para el Modelado y la Simulación Internacional . 87 (10). Sage Publications: 893–910. doi :10.1177/0037549710375437. S2CID  206429690.
  11. ^ G. Stamatakos; D. Dionysiou; A. Lunzer; R. Belleman; E. Kolokotroni; E. Georgiadi; M. Erdt; J. Pukacki; S. Rueping; S. Giatili; A. d'Onofrio; S. Sfakianakis; K. Marias; C. Desmedt; M. Tsiknakis; N. Graf (2014). "El oncosimulador tecnológicamente integrado: combinación de modelado de cáncer multiescala con tecnología de la información en el contexto de oncología in silico". Revista IEEE de informática biomédica y de salud . 18 (3): 840–854. doi :10.1109/JBHI.2013.2284276.
  12. ^ Nicholls, Henry (2008). "Vacuna in silico". Nature Biotechnology . 26 (6): 597. doi : 10.1038/nbt0608-597b . S2CID  32402661.
  13. ^ "Antecedentes".
  14. ^ Martí-Bonmatí, Luis; et al. (2020). "Proyecto PRIMAGE: análisis multiescala predictivo in silico para apoyar la evaluación personalizada del cáncer infantil potenciada por biomarcadores de imagen". European Radiology Experimental . 4 (1): 22. doi : 10.1186/s41747-020-00150-9 . PMC 7125275 . PMID  32246291. 
  15. ^ "Conferencia Médica CADFEM". conference.cadfem-medical.com . Consultado el 28 de septiembre de 2021 .
  16. ^ Sokolowski, John A., Banks, Catherine M. Modelado y simulación en las ciencias médicas y de la salud. Hooken: Wiley, c2011.