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Dominio compositivo

Ejemplo de una secuencia genómica hipotética compuesta por 9 dominios de composición homogéneos utilizados para demostrar el modelo. El algoritmo de segmentación dividió la secuencia e identificó correctamente 4 dominios como dominios de composición homogéneos y 2 dominios de composición no homogéneos. [ se necesita una fuente no primaria ]

Un dominio composicional en genética es una región de ADN con un contenido distintivo de GC y CG de guanina (G) y citosina (C) (colectivamente contenido GC ). [1] La homogeneidad de los dominios composicionales se compara con la del cromosoma en el que residen. Como tal, los dominios composicionales pueden ser dominios homogéneos o no homogéneos. Los dominios composicionalmente homogéneos que son suficientemente largos (= 300 kb) se denominan isocoros o dominios isocóricos.

El modelo de dominio compositivo se propuso como una alternativa al modelo isocórico . El modelo isocórico fue propuesto por Bernardi y sus colegas para explicar la falta de uniformidad observada en los fragmentos genómicos del genoma. [2] Sin embargo, la secuenciación reciente de datos genómicos completos refutó el modelo isocórico. Sus principales predicciones fueron:

El modelo de dominio composicional describe el genoma como un mosaico de dominios cortos y largos homogéneos y no homogéneos. La composición y organización de los dominios fueron moldeadas por diferentes procesos evolutivos que fusionaron o desintegraron los dominios. Este modelo de organización genómica fue confirmado en muchos estudios genómicos nuevos de genomas de vacas, [14] abejas, [15] erizos de mar, [16] piojos del cuerpo, [17] Nasonia , [18] escarabajos, [19] y hormigas. [20] [21] [22] El genoma humano fue descrito como consistente en una mezcla de dominios composicionalmente no homogéneos con numerosos dominios cortos composicionalmente homogéneos y relativamente pocos dominios largos. [1]

Referencias

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