Coeficiente de endogamia

Estimación matemática de la endogamia

El coeficiente de endogamia ( COI ) es un número que mide qué tan endogámico es un individuo. Específicamente, es la probabilidad de que dos alelos en cualquier locus de un individuo sean idénticos por descendencia de un ancestro común de los dos padres. ^{[1] [2] [3] [4]} Un COI más alto hará que los rasgos de la descendencia sean más predecibles, pero también aumentará el riesgo de problemas de salud. En la cría de perros, se recomienda mantener el COI por debajo del 5%; sin embargo, en algunas razas esto puede no ser posible sin un cruzamiento . ^[5]

Cálculo

Se dice que un individuo es endogámico si hay un bucle en su cuadro genealógico . Un bucle se define como un camino que va desde un individuo hasta el ancestro común a través de uno de los padres y regresa al otro padre, sin pasar por ningún individuo dos veces. El número de bucles es siempre el número de ancestros comunes que tienen los padres. Si un individuo es consanguíneo, el coeficiente de consanguinidad se calcula sumando todas las probabilidades de que un individuo reciba el mismo alelo por parte de su padre y de su madre. Como cada individuo tiene un 50% de posibilidades de transmitir un alelo a la siguiente generación, la fórmula depende de 0,5 elevado a la potencia de cuantas generaciones separan al individuo del ancestro común de sus padres, tanto por parte del padre como por parte de la madre. . Este número de generaciones se puede calcular contando cuántos individuos se encuentran en el ciclo definido anteriormente. Así, el coeficiente de consanguinidad (f) de un individuo X se puede calcular con la siguiente fórmula: ^{[6] [1]}

$${\displaystyle f_{X}=\sum 0.5^{n-1}\cdot (1+f_{A})}$$donde es el número de individuos en el ciclo antes mencionado y es el coeficiente de endogamia del ancestro común de los padres de X. ${\displaystyle n}$
${\displaystyle f_{A}}$

Para dar un ejemplo, considere el siguiente pedigrí.

G es la progenie de C y F, y C es el tío biológico de F.

En este cuadro genealógico, G es la progenie de C y F, y C es el tío biológico de F. Para encontrar el coeficiente de endogamia de G, primero ubique un bucle que conduzca desde G hasta el ancestro común a través de uno de los padres y regrese hacia abajo. al otro padre sin pasar por el mismo individuo dos veces. Solo hay dos bucles de este tipo en este cuadro, ya que solo hay 2 ancestros comunes de C y F. Los bucles son G - C - A - D - F y G - C - B - D - F, los cuales tienen 5 miembros.

Debido a que los ancestros comunes de los padres (A y B) no son endogámicos, . Por tanto, el coeficiente de consanguinidad del individuo G es . ${\displaystyle f_{A}=0}$ ${\displaystyle f_{G}=\sum 0.5^{5-1}\cdot (1+0)=0.5^{4}+0.5^{4}=12.5\%}$

Si los padres de un individuo no son consanguíneos, el coeficiente de consanguinidad del individuo es la mitad del coeficiente de parentesco entre los padres. Esto se puede comprobar en el ejemplo anterior, ya que 12,5% es la mitad del 25%, el coeficiente de parentesco entre un tío y una sobrina.

Tabla de coeficientes de endogamia.

^R En este punto, los individuos se consideran parte de una cepa endogámica y cada individuo puede considerarse efectivamente como clones .

Referencias

1. Wright, Sewall (1922), "Coeficientes de endogamia y relación", The American Naturalist , vol. 56, págs. 330–338, doi : 10.1086/279872
2. Redei, George P. (2004), Diccionario enciclopédico de genética, genómica y proteómica , John Wiley and Sons, Inc.
3. Charlesworth, Deborah (2005), "Endogamia", Enciclopedia de ciencias biológicas , John Wiley and Sons, Inc.
4. Halconero, DS; Mackay, TFC (1996), Introducción a la genética cuantitativa (4 ed.), Longman
5. Carol Beuchat (4 de junio de 2015). "Preguntas frecuentes sobre COI: comprensión del coeficiente de endogamia". El Instituto de Biología Canina . Consultado el 5 de febrero de 2024 .
6. Schonewald-Cox, CM, SM Chambers, B. MacBryde y L. Thomas (eds.). 1983. Genética y Conservación. Benjamín/Cummings, Menlo Park, California.