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Cistrome

En términos simples, el cistroma se refiere a una colección de elementos reguladores de un conjunto de genes, incluidos los sitios de unión de factores de transcripción y las modificaciones de histonas. Más específicamente, "el conjunto de objetivos que actúan en cis de un factor que actúa en trans a escala de todo el genoma, también conocido como la ubicación in vivo en todo el genoma de los sitios de unión de factores de transcripción o modificaciones de histonas ". [1] El término cistroma es un acrónimo de cistr (de cistron ) + ome (de genome ). El término cistroma fue acuñado por investigadores del Instituto de Cáncer Dana-Farber y la Facultad de Medicina de Harvard . [2]

Tecnologías como la inmunoprecipitación de cromatina combinada con el análisis de microarrays “ ChIP-on-chip ” o con la secuenciación masiva paralela de ADN “ ChIP-Seq ” han facilitado enormemente la definición del cistroma de los factores de transcripción y otras proteínas asociadas a la cromatina .

Referencias

  1. ^ Liu T, Ortiz JA, Taing L, Meyer CA, Lee B, Zhang Y, Shin H, Wong SS, Ma J, Lei Y, Pape UJ, Poidinger M, Chen Y, Yeung K, Brown M, Turpaz Y, Liu XS (2011). "Cistrome: una plataforma integradora para estudios de regulación transcripcional". Genome Biol . 12 (8): R83. doi : 10.1186/gb-2011-12-8-r83 . PMC  3245621. PMID  21859476 .
  2. ^ "cistrome / Página principal". PBWiki, Inc.

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