Ciclina K

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La ciclina-K es una proteína que en los humanos está codificada por el gen CCNK . ^{[5] [6] [7]}

Función

La proteína codificada por este gen es un miembro de la familia de ciclinas de transcripción. Estas ciclinas pueden regular la transcripción a través de su asociación con y activación de las quinasas dependientes de ciclina (CDK) a través de cambios conformacionales. ^{[8] [9]} La activación de las CDK a través de su pareja ciclina, crea complejos de quinasas que activarán las proteínas objetivo a través de la fosforilación . Las proteínas objetivo pueden, en última instancia, regular las decisiones de la progresión de una célula dentro del ciclo celular . Se puede ver que este producto génico desempeña un papel doble en la regulación de las actividades de las CDK y de la ARN polimerasa II (RNAP2). ^[7] La ​​ciclina K solo utiliza el reclutamiento de ARN para activar la transcripción. ^[10]

Interacciones

Se ha demostrado que la ciclina K interactúa con múltiples CDK, incluidas CDK9 y las últimas CDK12 y CDK13. ^{[6] [9]} Las funciones incluyen ayudar a fosforilar los dominios C-terminales de las subunidades de RNAP2. ^[11] La ciclina K es más conocida por su inducción asociada de elongación procesiva. ^[8] También se identifica con la actividad de ciclina de fase G1 y S , sin embargo, las funciones no se comprenden en profundidad. ^{[5] [12]}

La ciclina K también interactúa con la proteína nef del VIH. ^[13] En presencia de proteína Nef sobreexpresada, se induce la unión de la ciclina k y CDK9, inhibiendo el factor de elongación positivo de otros complejos de unión de CDK9, lo que da como resultado una inhibición de la expresión de genes específicos del VIH-1. ^{[9] [13]} La CDK 13 también puede caracterizarse por interactuar con el empalme del ARNm del VIH, junto con Nef, y la subexpresión de las proteínas relacionadas con Gag y Env. ^{[12] [10]}

La ciclina K es indispensable para el crecimiento de la leucemia. También se sabe que SETD1A se une a la ciclina K a través de su dominio FLOS. ^[14] Se ha demostrado que la interacción es importante para los genes de respuesta al daño del ADN y para la proliferación de la leucemia. ^{[10] [14]}

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000090061 – Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000021258 – Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
5. Edwards MC, Wong C, Elledge SJ (julio de 1998). "Ciclina K humana, una nueva ciclina asociada a la ARN polimerasa II que posee actividad de quinasa del dominio carboxiterminal y de quinasa activadora de Cdk". Biología molecular y celular . 18 (7): 4291–300. doi :10.1128/MCB.18.7.4291. PMC 109013 . PMID  9632813. 
6. Fu TJ, Peng J, Lee G, Price DH, Flores O (diciembre de 1999). "La ciclina K funciona como una subunidad reguladora de CDK9 y participa en la transcripción de la ARN polimerasa II". The Journal of Biological Chemistry . 274 (49): 34527–30. doi : 10.1074/jbc.274.49.34527 . PMID  10574912.
7. "Entrez Gene: CCNK ciclina K".
8. Baek K, Brown RS, Birrane G, Ladias JA (febrero de 2007). "Estructura cristalina de la ciclina K humana, un regulador positivo de la quinasa 9 dependiente de ciclina". Journal of Molecular Biology . 366 (2): 563–73. doi :10.1016/j.jmb.2006.11.057. PMC 1852425 . PMID  17169370. 
9. Greifenberg AK, Hönig D, Pilarova K, Düster R, Bartholomeeusen K, Bösken CA, Anand K, Blazek D, Geyer M (enero de 2016). "Análisis estructural y funcional del complejo Cdk13/ciclina K". Cell Reports . 14 (2): 320–31. doi : 10.1016/j.celrep.2015.12.025 . hdl : 11858/00-001M-0000-0029-567D-5 . PMID  26748711.
10. Kohoutek J, Blazek D (abril de 2012). "La ciclina K se une a Cdk12 y Cdk13". División celular . 7 : 12. doi : 10.1186/1747-1028-7-12 . PMC 3348076 . PMID  22512864. 
11. Edwards MC, Wong C, Elledge SJ (julio de 1998). "Ciclina K humana, una nueva ciclina asociada a la ARN polimerasa II que posee actividad de quinasa del dominio carboxiterminal y de quinasa activadora de Cdk". Biología molecular y celular . 18 (7): 4291–300. doi :10.1128/mcb.18.7.4291. PMC 109013 . PMID  9632813. 
12. Berro R, Pedati C, Kehn-Hall K, Wu W, Klase Z, Even Y, Genevière AM, Ammosova T, Nekhai S, Kashanchi F (julio de 2008). "CDK13, un nuevo factor inhibidor potencial del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 que regula el empalme del ARNm viral". Revista de Virología . 82 (14): 7155–66. doi :10.1128/JVI.02543-07. PMC 2446983 . PMID  18480452. 
13. Khan SZ, Mitra D (julio de 2011). "La ciclina K inhibe la expresión y replicación del gen del VIH-1 al interferir con la interacción de la quinasa dependiente de ciclina 9 (CDK9) con la ciclina T1 de manera dependiente de Nef". The Journal of Biological Chemistry . 286 (26): 22943–54. doi : 10.1074/jbc.M110.201194 . PMC 3123062 . PMID  21555514. 
14. Hoshii T, Cifani P, Feng Z, Huang CH, Koche R, Chen CW, Delaney CD, Lowe SW, Kentsis A, Armstrong SA (febrero de 2018). "Una función no catalítica de SETD1A regula la ciclina K y la respuesta al daño del ADN". Cell . 172 (5): 1007–1021.e17. doi :10.1016/j.cell.2018.01.032. PMC 6052445 . PMID  29474905. 

Lectura adicional

• Lin X, Taube R, Fujinaga K, Peterlin BM (mayo de 2002). "P-TEFb que contiene ciclina K y Cdk9 puede activar la transcripción a través del ARN". The Journal of Biological Chemistry . 277 (19): 16873–8. doi : 10.1074/jbc.M200117200 . PMID  11884399.
• Mori T, Anazawa Y, Matsui K, Fukuda S, Nakamura Y, Arakawa H (2002). "Ciclina K como diana transcripcional directa del supresor tumoral p53". Neoplasia . 4 (3): 268–74. doi :10.1038/sj.neo.7900235. PMC  1531701 . PMID  11988847.
• Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (agosto de 2004). "Caracterización a gran escala de las fosfoproteínas nucleares de células HeLa". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (33): 12130–5. Bibcode :2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446 . PMID  15302935.
• Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (mayo de 2006). "Una red de interacción proteína-proteína para las ataxias hereditarias humanas y los trastornos de la degeneración de las células de Purkinje". Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID  16713569.
• Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (noviembre de 2006). "Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización". Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983.
• Baek K, Brown RS, Birrane G, Ladias JA (febrero de 2007). "Estructura cristalina de la ciclina K humana, un regulador positivo de la quinasa 9 dependiente de ciclina". Journal of Molecular Biology . 366 (2): 563–73. doi :10.1016/j.jmb.2006.11.057. PMC  1852425 . PMID  17169370.

Enlaces externos

• Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : O75909 (Ciclina-K) en el PDBe-KB .