stringtranslate.com

Endopeptidasa Clp

Endopeptidasa Clp ( EC 3.4.21.92, endopeptidasa Ti , proteasa caseinolítica , proteasa Ti , proteasa Clp dependiente de ATP , ClpP , proteasa Clp ). [1] [2] [3] [4] Esta enzima cataliza la siguiente reacción química

Hidrólisis de proteínas a pequeños péptidos en presencia de ATP y Mg 2+ .

Esta enzima bacteriana contiene subunidades de dos tipos, ClpP , con actividad peptidasa , y la proteína ClpA, con actividad AAA+ ATPasa . ClpP y ClpA no están relacionados evolutivamente.

Un complejo de proteasa Clp completamente ensamblado tiene una estructura en forma de barril en la que dos anillos heptaméricos apilados de subunidades proteolíticas (ClpP o ClpQ) están intercalados entre dos anillos o con una sola capa por un anillo de subunidades chaperonas activas en ATPasa hexamérica (ClpA, ClpC). , ClpE, ClpX , ClpY u otros). [5]

ClpXP se presenta en casi todas las bacterias, mientras que ClpA se encuentra en las bacterias Gram negativas, ClpC en las bacterias Gram positivas y cianobacterias. ClpAP, ClpXP y ClpYQ coexisten en E. coli, mientras que solo el complejo ClpXP está presente en humanos como enzimas mitocondriales. [5] ClpYQ es otro nombre para el complejo HslVU , un complejo de proteínas de choque térmico que se cree que se parece al hipotético ancestro del proteosoma . [6]

ATPasa

La familia Hsp100 de proteínas de choque térmico eucariotas es homóloga a las subunidades chaperonas activas de ATPasa que se encuentran en el complejo Clp; como tal, a todo el grupo se le suele denominar familia HSP100/Clp . La familia generalmente se divide en dos partes, una es la familia ClpA/B con dos dominios ATPasa y la otra es ClpX y amigos con solo uno de esos dominios. [7] ClpA a E se incluye en el primer grupo junto con Hsp78/104, y ClpX y HSIU se incluyen en el segundo grupo. [8]

Muchas de las proteínas no están asociadas con una proteasa y tienen funciones distintas a la proteólisis. ClpB ( CLPB "Hsp78" humana, Hsp104 de levadura ) descompone agregados de proteínas insolubles junto con DnaK/ Hsp70 . Se cree que funcionan enhebrando proteínas cliente a través de un pequeño poro de 20 Å (2 nm ), dando así a cada proteína cliente una segunda oportunidad de plegarse. [8] [9] [10] Un miembro de la familia ClpA/B denominado ClpV se utiliza en el T6SS bacteriano . [11]

Ver también

Referencias

  1. ^ Gottesman S, Clark WP, Maurizi MR (mayo de 1990). "La proteasa Clp dependiente de ATP de Escherichia coli. Secuencia de clpA e identificación de un sustrato específico de Clp". La Revista de Química Biológica . 265 (14): 7886–93. PMID  2186030.
  2. ^ Maurizi MR, Clark WP, Katayama Y, Rudikoff S, Pumphrey J, Bowers B, Gottesman S (julio de 1990). "Secuencia y estructura de Clp P, el componente proteolítico de la proteasa Clp dependiente de ATP de Escherichia coli". La Revista de Química Biológica . 265 (21): 12536–45. PMID  2197275.
  3. ^ Maurizi MR, Thompson MW, Singh SK, Kim SH (1994). Endopeptidasa Clp: proteasa Clp dependiente de ATP de Escherichia coli . Métodos en enzimología. vol. 244, págs. 314–31. doi :10.1016/0076-6879(94)44025-5. PMID  7845217.
  4. ^ Kessel M, Maurizi MR, Kim B, Kocsis E, Trus BL, Singh SK, Steven AC (julio de 1995). "Homología en la organización estructural entre la proteasa ClpAP de E. coli y el proteosoma eucariota 26 S". Revista de biología molecular . 250 (5): 587–94. doi :10.1006/jmbi.1995.0400. PMID  7623377.
  5. ^ ab Hamon MP, Bulteau AL, Friguet B (septiembre de 2015). "Proteasas mitocondriales y control de calidad de proteínas en el envejecimiento y la longevidad". Reseñas de investigaciones sobre el envejecimiento . 23 (Parte A): 56–66. doi :10.1016/j.arr.2014.12.010. PMID  25578288. S2CID  205667759.
  6. ^ Gille C, Goede A, Schlöetelburg C, Preissner R, Kloetzel PM, Göbel UB, Frömmel C (marzo de 2003). "Una visión integral de las secuencias proteasómicas: implicaciones para la evolución del proteasoma". Revista de biología molecular . 326 (5): 1437–48. doi :10.1016/s0022-2836(02)01470-5. PMID  12595256.
  7. ^ Schirmer EC, Glover JR, Singer MA, Lindquist S (agosto de 1996). "Proteínas HSP100/Clp: un mecanismo común explica diversas funciones". Tendencias en Ciencias Bioquímicas . 21 (8): 289–96. doi :10.1016/S0968-0004(96)10038-4. PMID  8772382.
  8. ^ ab Doyle SM, Wickner S (enero de 2009). "Hsp104 y ClpB: máquinas desagregadoras de proteínas". Tendencias en Ciencias Bioquímicas . 34 (1): 40–8. doi :10.1016/j.tibs.2008.09.010. PMID  19008106.
  9. ^ Horwich AL (noviembre de 2004). "Desagregación de proteínas acompañada: el anillo ClpB utiliza su canal central". Celúla . 119 (5): 579–81. doi : 10.1016/j.cell.2004.11.018 . PMID  15550237.
  10. ^ Weibezahn J, Tessarz P, Schlieker C, Zahn R, Maglica Z, Lee S, et al. (noviembre de 2004). "La termotolerancia requiere el replegamiento de proteínas agregadas mediante la translocación del sustrato a través del poro central de ClpB". Celúla . 119 (5): 653–65. doi : 10.1016/j.cell.2004.11.027 . PMID  15550247.
  11. ^ Schlieker C, Zentgraf H, Dersch P, Mogk A (noviembre de 2005). "ClpV, un miembro único de Hsp100/Clp de proteobacterias patógenas". Química Biológica . 386 (11): 1115–27. doi :10.1515/BC.2005.128. PMID  16307477. S2CID  34095247.

enlaces externos