El biopanning es una técnica de selección por afinidad que selecciona péptidos que se unen a un objetivo determinado . [1] Todas las secuencias de péptidos obtenidas a partir de biopanning utilizando bibliotecas combinatorias de péptidos se han almacenado en una base de datos especial disponible gratuitamente denominada BDB. [2] [3] Esta técnica también se utiliza a menudo para la selección de anticuerpos .
La biopanning implica 4 pasos principales para la selección de péptidos. [4] El primer paso es tener preparadas bibliotecas de presentación de fagos . Esto implica insertar segmentos de genes extraños deseados en una región del genoma del bacteriófago , de modo que el producto peptídico se presente en la superficie del virión del bacteriófago. Los más utilizados son los genes pIII o pVIII del bacteriófago M13 . [5] El siguiente paso es el de captura. Implica conjugar la biblioteca de fagos con el objetivo deseado. Este procedimiento se denomina panorámica. Utiliza las interacciones de unión para que solo los péptidos específicos presentados por el bacteriófago se unan al objetivo. Por ejemplo, seleccionar anticuerpo presentado por bacteriófago con antígeno recubierto en placas de microtitulación.
El paso de lavado viene después del paso de captura para eliminar los fagos no unidos de la superficie sólida. Sólo se conservan los fagos unidos con fuerte afinidad. El paso final implica el paso de elución en el que los fagos unidos se eluyen mediante cambios de pH u otras condiciones ambientales.
El resultado final es que los péptidos producidos por el bacteriófago son específicos. Los fagos filamentosos resultantes pueden infectar bacterias gramnegativas una vez más para producir bibliotecas de fagos. El ciclo puede ocurrir muchas veces, lo que resulta en una fuerte afinidad de unión de los péptidos al objetivo.