En biología molecular y genética , upstream y downstream se refieren a posiciones relativas del código genético en ADN o ARN . Cada hebra de ADN o ARN tiene un extremo 5' y un extremo 3' , llamados así por la posición del carbono en el anillo de desoxirribosa (o ribosa ). Por convención, upstream y downstream se relacionan con la dirección 5' a 3' respectivamente en la que tiene lugar la transcripción del ARN . [1] Upstream es hacia el extremo 5' de la molécula de ARN y downstream es hacia el extremo 3'. Cuando se considera ADN bicatenario, upstream es hacia el extremo 5' de la hebra codificante para el gen en cuestión y downstream es hacia el extremo 3'. Debido a la naturaleza antiparalela del ADN, esto significa que el extremo 3' de la hebra molde está upstream del gen y el extremo 5' downstream.
Algunos genes de la misma molécula de ADN pueden transcribirse en direcciones opuestas. Esto significa que las zonas anteriores y posteriores de la molécula pueden cambiar según el gen que se utilice como referencia.
Los términos upstream y downstream a veces también se aplican a una secuencia polipeptídica, donde upstream se refiere a una región N-terminal y downstream a los residuos C-terminales de un punto de referencia.