Las elecciones regionales de Cerdeña de 1999 tuvieron lugar los días 13 y 27 de junio de 1999.
La coalición de centro derecha encabezada por Mauro Pili ganó las elecciones, pero no alcanzó una mayoría clara; Pili, que fue nombrado Presidente de la Región, no pudo formar una mayoría y pronto fue reemplazado por el candidato derrotado, Gian Mario Selis, que no pudo ganarse el voto de confianza del Consejo Regional. Al ex presidente Mario Floris se le pidió formar gobierno evitando nuevas elecciones regionales.