stringtranslate.com

Análisis de varianza molecular

El análisis de varianza molecular ( AMOVA ) es un modelo estadístico para el algoritmo molecular en una sola especie , típicamente biológica . [1] El nombre y el modelo están inspirados en ANOVA . El método fue desarrollado por Laurent Excoffier, Peter Smouse y Joseph Quattro en la Universidad Rutgers en 1992.

Desde que desarrolló AMOVA, Excoffier ha escrito un programa para ejecutar dichos análisis. Este programa, que corre en Windows , se llama Arlequin y está disponible gratuitamente en el sitio web de Excoffier. También existen implementaciones en lenguaje R en los paquetes ade4 y pegas, ambos disponibles en CRAN (Comprehensive R Archive Network). Otra implementación está en Info-Gen, que también corre en Windows . La versión para estudiantes es gratuita y completamente funcional. El idioma nativo de la aplicación es el español, pero también hay una versión en inglés disponible.

Un paquete estadístico gratuito adicional, GenAlEx, [2] está orientado tanto a la enseñanza como a la investigación y permite realizar análisis genéticos complejos y compararlos dentro de la interfaz de Microsoft Excel, de uso común. Este software permite realizar cálculos de análisis como AMOVA, así como comparaciones con otros tipos de estadísticas estrechamente relacionadas, como las estadísticas F y el índice de Shannon, entre otras.

Referencias

  1. ^ Excoffier, L; Smouse, Pe; Quattro, Jm (junio de 1992). "Análisis de la varianza molecular inferida a partir de distancias métricas entre haplotipos de ADN: aplicación a datos de restricción de ADN mitocondrial humano" (Texto completo gratuito) . Genética . 131 (2): 479–91. doi :10.1093/genetics/131.2.479. ISSN  0016-6731. PMC 1205020.  PMID 1644282  .
  2. ^ Peakall, R. y Smouse PE (2012) GenAlEx 6.5: análisis genético en Excel. Software de genética de poblaciones para la enseñanza y la investigación: una actualización. Bioinformática 28, 2537–2539.

Enlaces externos