El torneo de béisbol de la División I de la NCAA de 2003 se celebró del 30 de mayo al 23 de junio de 2003. Sesenta y cuatro equipos de béisbol universitario de la División I de la NCAA se enfrentaron después de haber jugado durante una temporada regular y, en algunos casos, un torneo de conferencia, para jugar en el torneo de la NCAA. El torneo culminó con 8 equipos en la Serie Mundial Universitaria en el histórico Estadio Rosenblatt en Omaha, Nebraska .
ESPN , que tenía los derechos de la Serie Mundial Universitaria, comenzó a televisar juegos superregionales en 2003. Como parte del contrato con ESPN, cuatro superregionales comenzarían el viernes y durarían hasta el domingo, mientras que las otras cuatro superregionales comenzarían el sábado y durarían hasta el lunes.
En la Serie Mundial Universitaria de 2003 se modificó el formato y el campeonato se decidió con una serie al mejor de tres. Desde 1950 hasta 1987, la Serie Mundial Universitaria fue un verdadero torneo de doble eliminación. Desde 1988 hasta 2002, hubo dos grupos de doble eliminación, y el ganador de cada uno de ellos se enfrentaba en un campeonato de un solo partido.
En la serie de campeonato de 2003, Rice derrotó a Stanford por dos juegos a uno. John Hudgins se convirtió en el decimosexto jugador en ganar el premio al Jugador Más Destacado de la Serie Mundial Universitaria de un equipo perdedor.
Los campeones de las 30 conferencias de la División I obtuvieron invitaciones automáticas para las regionales. Las 34 plazas restantes se otorgaron a las escuelas como invitadas generales.
En negrita se indica participante de CWS.
En negrita se indica el ganador.
La Súper Regional de Houston fue organizada por Rice en Reckling Park .
Los siguientes jugadores fueron miembros del Equipo del Torneo de la Serie Mundial Universitaria.