El Magdeburger FFC es un club de fútbol femenino de Magdeburgo . El club fue fundado en 1997 y en 2009 consiguió el ascenso a la 2. Bundesliga de fútbol .
El club tiene sus orígenes en el club deportivo local SG Handwerk Magdeburg . En la única liga oficial de Alemania del Este , la temporada 1990-91, el equipo acabó último. En 1991, el departamento de fútbol se unió al SV Fortuna Magdeburg , pero en los años siguientes el rendimiento del equipo fue irregular. Tras unos cuantos resultados en la mitad de la tabla, el equipo luchó contra el descenso a finales de los años 90. En 1997, el departamento de fútbol volvió a abandonar el club y creó un nuevo club, el FSV Fortuna Magdeburg/Wolmirstedt . Para enfatizar aún más su independencia del Fortuna Magdeburg, el club cambió su nombre a Magdeburger FFC el 1 de julio de 2003.
Un año después, el Magdeburgo se quedó a las puertas de la recién creada 2.ª Bundesliga, quedando en el sexto puesto de la Regionalliga. En la DFB-Pokal, el equipo alcanzó la segunda ronda por primera vez en su historia, perdiendo 0-6 ante el FFC Heike Rheine de la Bundesliga . Hasta julio de 2010, el Magdeburgo se había clasificado para la DFB-Pokal en 14 ocasiones, doce de ellas al ganar la Copa de Sajonia-Anhalt y dos veces por pertenecer a la 2.ª Bundesliga.
En los tres años siguientes, de 2005 a 2007, el Magdeburgo acabó segundo en la Regionalliga. En la temporada 2006-07, el club luchó por el campeonato contra el 1. FC Union Berlin y el SV Blau-Weiß Hohen Neuendorf, pero como el Magdeburgo no había solicitado una licencia para la 2. Bundesliga, ganar el campeonato no habría significado el ascenso. En 2009, el equipo acabó primero y ascendió a la 2. Fußball-Bundesliga Nord. En su primera temporada en la Bundesliga acabó sexto.
El equipo de reserva logró el ascenso a la Regionalliga Nordost en la temporada 2009-10, además el club cuenta con varios equipos juveniles, que van desde un equipo Sub-11 hasta dos equipos Sub-17.