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África occidental basal

El África occidental basal es una línea de descendencia hipotética [1] [2] que ya no existe. [3]

Historia

Utilizando a los africanos occidentales (por ejemplo, los esan de Nigeria , los mende de Sierra Leona , los gambianos occidentales ), se aproxima que la divergencia de un conjunto de humanos modernos o arcaicos tempranos, que suman alrededor de 25.000 o entre 23.000 y 27.000, del último ancestro común del pueblo san y todos los demás humanos modernos ocurrió entre 1.020.000 AP y 360.000 AP. [4] Incluso antes de 300.000 AP a 200.000 AP, cuando los ancestros de los san modernos se separaron de otros humanos modernos, el grupo que se separó más temprano de los humanos modernos puede haber sido los africanos occidentales basales. [5] Sin embargo, los africanos occidentales basales no se separaron antes de que los neandertales se separaran de los humanos modernos, [5] por lo que esto descartaría el extremo superior (1.020.000 AP) del rango de aproximación.

Entre 124.000 y 0 AP, entre el 2% y el 19% de los genes pueden haberse introgresado en los ancestros de los africanos occidentales modernos como resultado de la mezcla con esta población humana arcaica . [4] Los africanos occidentales modernos (por ejemplo, los yoruba de Ibadan , Nigeria, los mende de Sierra Leona) pueden tener más ascendencia de este linaje como resultado de su ascendencia de los africanos occidentales basales. [4] [6] El mismo estudio también sugiere que al menos parte de esta mezcla arcaica también está presente en los euroasiáticos/no africanos, y que el evento o eventos de mezcla varían de 0 a 124 ka AP, que incluye el período anterior a la migración fuera de África y anterior a la división africana/euroasiática (afectando así en parte a los ancestros comunes de africanos y euroasiáticos/no africanos). [7] [8] [9] Chen et al. (2020) descubrieron que los africanos tienen una ascendencia neandertal mayor de lo que se creía anteriormente. Se analizaron y analizaron 2504 muestras africanas de toda África para determinar su ascendencia neandertal. Todas las muestras africanas mostraron evidencia de una ascendencia neandertal menor, pero siempre en niveles más bajos que los observados en los euroasiáticos. [10]

Cazadores-recolectores de África occidental, khoisan y taforalts

Mientras que un modelo menos simple (sin africanos occidentales basales) para la ascendencia de los recolectores de Shum Laka estaba compuesto por antiguos Taforalts de la cultura Iberomaurusian y africanos occidentales modernos, entre otros tipos de modelos , uno modeló la ascendencia de los recolectores de Shum Laka como 65% africanos occidentales basales y 35% cazadores-recolectores de África occidental de África central occidental . [11] Sin embargo, hay una ausencia de ascendencia africana occidental basal en los cazadores-recolectores modernos de Camerún . [11]

Los pueblos del sur de África (por ejemplo, los khoisan ), que son más cercanos en ascendencia a los pueblos de África oriental, son más distantes en ascendencia a los pueblos de África occidental. [1] [2] Si bien compiten con el modelo que apoya a los africanos del sur como el primer grupo en separarse de los humanos modernos, los africanos occidentales basales, como un linaje hipotético , apoyan dos modelos de igual probabilidad: un grupo basal temprano de África oriental, que fue parte de una antigua estructura genética en África, son parte de la ascendencia moderna de los africanos occidentales modernos (por ejemplo, yoruba, mende) o la ascendencia mezclada de los africanos occidentales modernos (por ejemplo, yoruba, mende) son el resultado de grupos basales migratorios tempranos de diferentes partes de África (es decir, África sudoriental , África occidental ). [1] [2]

Además de tener similitud con el remanente de un linaje africano subsahariano más basal (por ejemplo, un linaje africano occidental basal compartido entre los pueblos yoruba y mende), [5] [12] el ADN africano subsahariano en los taforalts de la cultura iberomaurusiana puede estar mejor representado por los africanos occidentales modernos (por ejemplo, los yoruba). [12]

Descendientes

Los pueblos yoruba y mende descienden de los africanos occidentales basales y de otro grupo de ancestros afines a los africanos orientales y no africanos, lo que es indicativo de una migración desde África oriental . [5] Los yoruba tienen menos ascendencia de los africanos occidentales basales que los mende, [5] que tienen una gran cantidad de ascendencia. [13] Más específicamente, los yoruba tienen un 9% de ascendencia de África occidental basal y los mende tienen un 13% de ascendencia de África occidental basal. [3]

Referencias

  1. ^ abc Capelli, Cristian; Montinaro, Francesco (24 de octubre de 2018). "Genética e historia de África meridional". Oxford Research Encyclopedia of African History . Oxford University Research Archive. pág. 7. doi :10.1093/acrefore/9780190277734.013.446. ISBN 978-0-19-027773-4. Número de identificación del sujeto  134983982.
  2. ^ abc Montinaro, Francesco; Capelli, Cristian (2018). "La historia evolutiva del sur de África". Current Opinion in Genetics & Development . 53 : 160. doi :10.1016/j.gde.2018.11.003. PMID  30522870. S2CID  54483869.
  3. ^ ab Vidal, Gerard Serra (2018). "Información sobre la historia demográfica humana de África a través del análisis de la secuencia del genoma completo" (PDF) . Universitat Pompeu Fabra Barcelona. pág. 162. S2CID  108974583.
  4. ^ abc Durvasula, Arun; Sankararaman, Sriram (2020). "Recuperación de señales de introgresión arcaica fantasma en poblaciones africanas". Science Advances . 6 (7): eaax5097. Bibcode :2020SciA....6.5097D. doi :10.1126 / sciadv.aax5097. ISSN  2375-2548. OCLC  8538353312. PMC 7015685. PMID  32095519. S2CID  211472946. 
  5. ^ abcde Skoglund, Pontus; et al. (2017). "Reconstrucción de la estructura de la población africana prehistórica". Cell . 171 (1): 59–71.e21. doi :10.1016/j.cell.2017.08.049. ISSN  0092-8674. OCLC  7144495602. PMC 5679310 . PMID  28938123. S2CID  1257429. 
  6. ^ Sirak, Kendra A.; Sawchuk, Elizabeth A.; Prendergast, Mary E. (18 de mayo de 2022). "ADN humano antiguo e historia de la población africana" (PDF) . Oxford Research Encyclopedia of African History . Oxford University Press. págs. 10-11.
  7. ^ Durvasula A, Sankararaman S (febrero de 2020). "Recuperación de señales de introgresión arcaica fantasma en poblaciones africanas". Science Advances . 6 (7): eaax5097. Bibcode :2020SciA....6.5097D. doi : 10.1126/sciadv.aax5097 . PMC 7015685 . PMID  32095519. "Las poblaciones no africanas (los chinos Han en Beijing y los residentes de Utah con ascendencia del norte y oeste de Europa) también muestran patrones análogos en el CSFS, lo que sugiere que un componente de la ascendencia arcaica era compartida antes de la división de las poblaciones africanas y no africanas... Una interpretación del tiempo reciente de introgresión que documentamos es que las formas arcaicas persistieron en África hasta hace poco. Alternativamente, la población arcaica podría haber introgresado antes en una población humana moderna, que luego se cruzó con los ancestros de las poblaciones que hemos analizado aquí. Los modelos que hemos explorado aquí no son mutuamente excluyentes, y es plausible que la historia de las poblaciones africanas incluya contribuciones genéticas de múltiples poblaciones divergentes, como lo demuestra el gran tamaño efectivo de la población asociada con la población arcaica introgresora... Dada la incertidumbre en nuestras estimaciones del tiempo de introgresión, nos preguntamos si analizar conjuntamente el CSFS tanto del CEU (residentes de Utah con ascendencia del norte y oeste de Europa) como del YRI Los genomas podrían proporcionar una resolución adicional. Con el modelo C, simulamos la introgresión antes y después de la división entre poblaciones africanas y no africanas y observamos diferencias cualitativas entre los dos modelos en los bins de alelos derivados de alta frecuencia del CSFS en poblaciones africanas y no africanas (fig. S40). Utilizando ABC para ajustar conjuntamente los bins de alelos derivados de alta frecuencia del CSFS en CEU e YRI (definidos como una frecuencia superior al 50 %), encontramos que el límite inferior del intervalo creíble del 95 % del tiempo de introgresión es más antiguo que la división simulada entre CEU e YRI (2800 frente a 2155 generaciones BP), lo que indica que al menos parte de los linajes arcaicos observados en el YRI también se comparten con el CEU..."
  8. ^ [1] Archivado el 7 de diciembre de 2020 en Wayback Machine. Materiales complementarios para recuperar señales de introgresión arcaica fantasma en poblaciones africanas", sección "S8.2" "Simulamos datos utilizando los mismos antecedentes en la Sección S5.2, pero calculamos el espectro tanto para YRI [Yoruba de África occidental] como para CEU [una población de origen europeo]. Descubrimos que los parámetros de mejor ajuste fueron un tiempo de división arcaico de hace 27 000 generaciones (95 % HPD: 26 000-28 000), una fracción de mezcla de 0,09 (95 % HPD: 0,04-0,17), un tiempo de mezcla de hace 3000 generaciones (95 % HPD: 2800-3400) y un tamaño de población efectivo de 19 700 individuos (95 % HPD: 19 300-20 200). Descubrimos que el límite inferior del tiempo de mezcla es más antiguo que la división simulada entre CEU e YRI (hace 2155 generaciones), lo que proporciona cierta evidencia a favor de un evento anterior a la salida de África. Este modelo sugiere que muchas poblaciones fuera de África también deberían contener haplotipos de este evento de introgresión, aunque la detección es difícil porque muchos métodos utilizan grupos externos no mezclados para detectar haplotipos introgresados ​​[Browning et al., 2018, Skov et al., 2018, Durvasula y Sankararaman, 2019] (5, 53, 22). También es posible que algunos de estos haplotipos se perdieran durante el cuello de botella de la salida de África".
  9. ^ Durvasula A, Sankararaman S (febrero de 2020). "Recuperación de señales de introgresión arcaica fantasma en poblaciones africanas". Science Advances . 6 (7): eaax5097. Bibcode :2020SciA....6.5097D. doi :10.1126/sciadv.aax5097. PMC 7015685 . PMID  32095519. 
  10. ^ Chen L, Wolf AB, Fu W, Li L, Akey JM (febrero de 2020). "Identificación e interpretación de la aparente ascendencia neandertal en individuos africanos". Cell . 180 (4): 677–687.e16. doi : 10.1016/j.cell.2020.01.012 . PMID  32004458. S2CID  210955842.
  11. ^ ab Lipson, Mark; et al. (2020). "Recolectores antiguos de África occidental en el contexto de la historia de la población africana". Nature . 577 ( 7792): 668–669. Bibcode :2020Natur.577..665L. doi :10.1038/s41586-020-1929-1. ISSN  0028-0836. OCLC  8516105991. PMC 8386425. PMID  31969706. S2CID  210862788. 
  12. ^ ab Jeong, Choongwon (2020). "Tendencias actuales en el estudio del ADN antiguo: más allá de la migración humana en Europa y sus alrededores". El manual de estudios sobre momias: nuevas fronteras en perspectivas científicas y culturales . Springer Nature. pág. 6. doi :10.1007/978-981-15-1614-6_10-1. ISBN 978-981-15-1614-6. OCLC  1182512815. S2CID  226555687.
  13. ^ Wonkam, Ambroise; et al. (2022). "La secuenciación del exoma de familias de Ghana revela genes candidatos y conocidos de discapacidad auditiva". Communications Biology . 5 (1): 369. doi :10.1038/s42003-022-03326-8. OCLC  9478623435. PMC 9019055. PMID  35440622. S2CID  248264573.