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Proteína G

La proteína G es una proteína de unión a inmunoglobulina expresada en bacterias estreptocócicas del grupo C y G, de forma muy similar a la proteína A, pero con diferentes especificidades de unión. Es una proteína de superficie celular de ~60 kDa (65 kDa para la cepa G148 y 58 kDa para la cepa C40) [1] que ha encontrado aplicación en la purificación de anticuerpos a través de su unión a la región Fab y Fc . La molécula nativa también se une a la albúmina , pero debido a que la albúmina sérica es un contaminante importante de las fuentes de anticuerpos, el sitio de unión de la albúmina se ha eliminado de las formas recombinantes de la proteína G. Esta proteína G recombinante, ya sea marcada con un fluoróforo o una cadena de ADN monocatenaria, se utilizó como reemplazo de anticuerpos secundarios en inmunofluorescencia e imágenes de súper resolución. [2]

Otras proteínas de unión a anticuerpos

Además de la proteína G, otras proteínas bacterianas que se unen a las inmunoglobulinas, como la proteína A , la proteína A/G y la proteína L, se utilizan habitualmente para purificar, inmovilizar o detectar inmunoglobulinas. Cada una de estas proteínas que se unen a las inmunoglobulinas tiene un perfil de unión de anticuerpos diferente en términos de la porción del anticuerpo que se reconoce y la especie y el tipo de anticuerpos a los que se unirá.

Plegamiento de la proteína G, dominio B1

Una simulación ab initio del dominio B1 de la proteína G demuestra que, como sugirieron resultados anteriores, esta proteína inicia el plegamiento a través de un evento de nucleación en los residuos centrales hidrofóbicos seguido de pequeños ajustes. [3] Los eventos de plegamiento son los siguientes:

  1. Se forma una horquilla β , estabilizada por los residuos W43, Y45 y F52.
  2. Los contactos residuales entre el residuo F30, en una hélice α , y la horquilla β se fortalecen.
  3. La nucleación de la hoja β se produce a partir de los residuos L5 y F52.
  4. El último residuo de nucleación, Y3, ayuda a formar la parte central de la hoja β, dando lugar a una proteína globular .

El dominio GB1 de la proteína G se utiliza a menudo como parte de una proteína de fusión para mantener otros dominios en solución durante experimentos en solución (por ejemplo, RMN ). Muchos dominios previamente insolubles se han vuelto solubles con la fusión del dominio GB1. [4] El dominio tiene 56 residuos (aproximadamente 8 kDa) de longitud. En geles SDS-PAGE, el dominio GB1 tiene aproximadamente 13,5 kDa a pesar de tener solo 8 kDa. [5]

Véase también

Referencias

  1. ^ Sjobring U, Bjorck L, Kastern W, et al. (1991). "Proteína G estreptocócica. Estructura genética y propiedades de unión a proteínas". J Biol Chem . 266 (1): 399–405. doi : 10.1016/S0021-9258(18)52448-0 . PMID  1985908.
  2. ^ Schlichthaerle, Thomas; Ganji, Mahipal; Auer, Alexander; Wade, Orsolya Kimbu; Jungmann, Ralf (2018). "Aglutinantes de anticuerpos derivados de bacterias como pequeños adaptadores para la microscopía DNA-PAINT". ChemBioChem . 20 (8): 1032–1038. doi :10.1002/cbic.201800743. hdl : 21.11116/0000-0003-E68E-A . ISSN  1439-7633. PMID  30589198. S2CID  58547594.
  3. ^ Kmiecik S, Kolinski A (febrero de 2008). "Vía de plegamiento del dominio b1 de la proteína G explorada mediante modelado multiescala". Biophys J . 94 (3): 726–36. Bibcode :2008BpJ....94..726K. doi :10.1529/biophysj.107.116095. PMC 2186257 . PMID  17890394. 
  4. ^ Cheng, Yuan; Patel, Dinshaw J. (2004). "Un sistema eficiente para la expresión y replegamiento de proteínas pequeñas". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 317 (2): 401–405. doi :10.1016/j.bbrc.2004.03.068. PMC 4693640. PMID  15063772 . 
  5. ^ Hartl MJ, Mayr F, Rethwilm A, Wöhrl BM (2010). "Propiedades biofísicas y enzimáticas de las transcriptasas inversas del virus espumoso de los simios y del prototipo". Retrovirology . 7 : 5. doi : 10.1186/1742-4690-7-5 . PMC 2835651 . PMID  20113504. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )