Después de graduarse con honores de la Escuela de Servicio Exterior de la Universidad de Georgetown y completar su doctorado en derecho en el Centro de Derecho de la Universidad de Georgetown en Washington, DC, Rodríguez-Ema regresó a Puerto Rico para trabajar como asociado en la división corporativa y bancaria de una importante firma de abogados en San Juan. Se concentró y enfocó su carrera legal temprana en los aspectos legales de transacciones financieras complejas para los clientes bancarios de la firma de abogados. Posteriormente fue reclutado por Drexel Burnham Lambert-Puerto Rico como vicepresidente, más tarde vicepresidente sénior, de su división de Finanzas Corporativas y Municipales. Fue responsable de la estructuración y ejecución de una variedad de emisiones de bonos y pagarés para el Gobierno de Puerto Rico, sus diversas dependencias, así como para los clientes privados de Drexel. En 1989, Rodríguez-Ema fue reclutado por Chase Manhattan Bank en Puerto Rico para administrar la unidad de banca de inversión de su subsidiaria Chase Securities Puerto Rico, convirtiéndose así en miembro del Comité de Gestión de Chase en Puerto Rico. Luego de las elecciones de noviembre de 1992, el gobernador electo de Puerto Rico le pidió que se uniera a su equipo fiscal y financiero como Presidente del Banco Gubernamental de Fomento para Puerto Rico (BGF). El BGF (www.gdb-pur.com) es el banco y agente fiscal del gobierno de Puerto Rico. Como tal, tiene la responsabilidad de coordinar, estructurar, ejecutar y colocar cada financiamiento, emisión de bonos o pagarés para todas las agencias gubernamentales, corporaciones propiedad del gobierno y sus múltiples dependencias, incluyendo los 78 municipios de Puerto Rico.
Como presidente del BGF, Rodríguez-Ema administró una institución altamente técnica y sofisticada de 400 empleados a través de un comité ejecutivo de 10 miembros de funcionarios superiores que respondían ante una junta directiva que se reunía mensualmente. También presidió todas las subsidiarias del BGF (incluida una subsidiaria de financiamiento de viviendas y una subsidiaria de desarrollo turístico, el Fondo de Desarrollo Turístico). Participó en varias juntas gubernamentales de alto perfil creando y construyendo constantemente consenso entre instituciones privadas y partes interesadas públicas para importantes políticas de desarrollo económico patrocinadas por el gobierno. También fue presidente de la junta directiva del Banco de Desarrollo Económico para Puerto Rico (otra institución financiera propiedad del gobierno) y presidente del Comité de Privatización del gobierno. Como jefe del Comité de Privatización, estuvo a cargo de la implementación de la política de privatización del gobierno, que implicó la disposición y venta de varios activos y dependencias importantes de propiedad del gobierno, incluida la Compañía de Teléfonos de Puerto Rico, la Autoridad de Navegación Marítima de Puerto Rico (Navieras) y varias propiedades hoteleras, centros de tratamiento de diagnóstico y hospitales de propiedad del gobierno. Durante este tiempo, fue responsable de la promoción, diseño y financiamiento del nuevo Museo de Arte de Puerto Rico y de la nueva instalación deportiva Coliseo de Puerto Rico en San Juan, entre muchos otros proyectos importantes. Fue el primer presidente de la junta de síndicos del Museo de Arte de Puerto Rico.
Tras dejar el gobierno en 1998, Rodríguez-Ema se incorporó a la mayor empresa familiar de desarrollo inmobiliario de Puerto Rico como director de desarrollo de nuevos negocios. Así, se encargó de la planificación y ejecución de varios proyectos importantes para las empresas, incluida la compra de bienes inmuebles en el continente para la expansión planificada de ciertos negocios familiares. Como parte de los asesores principales del presidente, tenía reuniones diarias para negociar y crear consenso entre pares sobre los diversos asuntos administrativos, operativos y legales relacionados con los proyectos de desarrollo, que incluían la construcción, expansión, financiamiento y mercadeo de centros comerciales, edificios de oficinas y condominios; también la compra, diseño y desarrollo de adquisiciones de terrenos baldíos, así como ocuparse del mercadeo y la gestión de la segunda empresa lechera y operación de procesamiento más grande de Puerto Rico.
En 2009, el recién electo gobernador Luis Fortuño le pidió a Rodríguez-Ema que abandonara el sector privado y se uniera a su gobierno como Jefe de Gabinete. La grave situación económica de Puerto Rico y la recesión persistente requerían líderes con una sólida formación empresarial y económica, excelentes habilidades de gestión y organización que fueran capaces de motivar, dinamizar e impulsar al gabinete del Gobernador en la implementación y rápida ejecución de importantes y complejas políticas fiscales, financieras y sociales. Como jefe de gabinete del gobernador, Rodríguez-Ema estaba a cargo de la supervisión inmediata de todas las agencias gubernamentales (más de 120 de ellas), la organización, redacción y ejecución de la voluminosa y necesaria legislación para hacer frente a la crisis económica, la coordinación del presupuesto estatal (más de $28 mil millones), así como la promoción y cabildeo activos de toda la legislación presupuestaria y de crisis económica en la Cámara de Representantes y el Senado. También fue el principal portavoz del Gobernador en todos los temas relevantes, así como el enlace con el Presidente de la Cámara de Representantes y el Presidente del Senado.
La reducción del tamaño del gobierno y los importantes recortes en contratos y servicios para reducir un asombroso déficit de 3.000 millones de dólares y evitar una rebaja en la calificación de los bonos que podría resultar catastrófica para la economía fueron iniciativas serias y trascendentales de proporciones históricas.
En diciembre de 2012, Rodríguez-Ema formó su propia firma de consultoría de negocios estratégicos llamada Proventus, llc, brindando a los clientes información valiosa y asesoramiento comercial y legal sobre los ciclos comerciales en constante cambio y desafiantes de Puerto Rico.