El equipo de baloncesto masculino Indiana Hoosiers de 1999-2000 representó a la Universidad de Indiana . Su entrenador principal fue Bobby Knight y, en última instancia, sería su última temporada completa entrenando a los Hoosiers. El equipo jugó sus partidos como local en Assembly Hall en Bloomington, Indiana , y fue miembro de la Conferencia Big Ten .
Los Hoosiers terminaron la temporada regular con un récord general de 20-9 y un récord de conferencia de 10-6, terminando en cuarto lugar en la Conferencia Big Ten. Después de perder contra los Fighting Illini en los cuartos de final del torneo Big Ten , los Hoosiers fueron invitados a jugar en el torneo NCAA de 2000. IU perdió en la primera ronda contra Pepperdine . [2]