Yet Another Scientific Artificial Reality Application ( YASARA ) es un programa informático para la visualización, modelado y dinámica molecular. Tiene muchos usos científicos, como lo demuestra la gran cantidad de artículos científicos que mencionan el software. [1] La versión gratuita de YASARA [2] es muy adecuada para la educación en bioinformática. Existe una serie de cursos de bioinformática disponibles gratuitamente que utilizan este software.
Estudiantes trabajando en una tarea educativa utilizando YASARA.
Krieger E, Koraimann G, Vriend G (mayo de 2002). "Aumento de la precisión de los modelos comparativos con YASARA NOVA: un campo de fuerza autoparametrizable". Proteins . 47 (3): 393–402. doi : 10.1002/prot.10104 . PMID 11948792.
Modelado: Krieger E, Vriend G (febrero de 2002). "Models@Home: computación distribuida en bioinformática utilizando un enfoque basado en salvapantallas". Bioinformática . 18 (2): 315–8. doi : 10.1093/bioinformatics/18.2.315 . PMID 11847079.
Dinámica: Krieger E, Darden T, Nabuurs SB, Finkelstein A, Vriend G (diciembre de 2004). "Cómo hacer un uso óptimo de las funciones de energía empíricas: parametrización del campo de fuerza en el espacio cristalino". Proteínas . 57 (4): 678–83. CiteSeerX 10.1.1.472.6529 . doi :10.1002/prot.20251. PMID 15390263.
