Los Watertown Pirates eran un equipo de béisbol de ligas menores Clase A de temporada corta ubicado en Watertown, Nueva York . El equipo jugó en la New York-Penn League de 1983 a 1998. Jugaron sus partidos en casa en el Duffy Fairgrounds Ball Park.
Desde 1983 hasta 1988 el club estuvo afiliado a los Piratas de Pittsburgh . Algunos jugadores Piratas notables de esta época son Tim Wakefield , Jay Buhner y Moisés Alou . En 1989, el equipo se convirtió en afiliado de los Indios de Cleveland y pasó a llamarse Indios de Watertown . El equipo se mudó a Staten Island, Nueva York para la temporada de 1999 y se convirtió en los Yankees de Staten Island .