stringtranslate.com

WDR75

( Ver también: Lista de proteínas en el cuerpo humano ) WDR75 es una proteína humana codificada por el gen WDR75 [1] que contiene un dominio de la superfamilia WD40. [2] El dominio WD40 se encuentra en muchos tipos de células eucariotas y se sabe que está involucrado en funciones de regulación celular como el procesamiento de pre-ARNm y el ensamblaje del citoesqueleto. [3] La función de la proteína WDR75 no está definida por la comunidad científica .

Secuencia de proteína

La secuencia de aminoácidos tiene 830 residuos de longitud y contiene una cola ácida. [4]

1 MVEEENIRVV RCGGSELNFR RAVFSADSKY IFCVSGDFVK VYSTVTEECV HILHGHRNLV61 TGIQLNPNNH LQLYSCSLDG TIKLWDYIDG ILIKTFIVGC KLHALFTLAQ AEDSVFVIVN121 OTROS DERECHOS RESERVADOS DE LA FECHA Y HORA DE LA FECHA181 YFFKKKTTSR FTLSSSRNKK HAKNNFTCVA CHPTEDCIAS GHMDGKIRLW RNFYDDKKYT241 YTCLHWHHDM VMDLAFSVTG TSLLSGGRES VLVEWRDATE KNKEFLPRLG ​​ATIEHISVSP301 AGDLFCTSHS DNKIIIIHRN LEASAVIQGL VKDRSIFTGL MIDPRTKALV LNGKPGHLQF361 YSLQSDKQLY NLDIIQQEYI NDYGLIQIEL TKAAFGCFGN WLATVEQRQE KETELELQMK421 LWMYNKKTQG FILNTKINMP HEDCITALCF CNAEKSEQPT LVTASKDGYF KVWILTDDSD481 IYKKAVGWTC DFVGSYHKYQ ATNCCFSEDG SLLAVSFEEI VTIWDSVTWE LKCTFCQRAG541 KIRHLCFGRL TCSKYLLGAT ENGILCCWNL LSCALEWNAK LNVRVMEPDP NSENIAAISQ601 SSVGSDLFVF KPSEPRPLYI QKGISREKVQ WGVFVPRDVP ESFTSEAYQW LNRSQFYFLT661 KSQSLLTFST KSPEEKLTPT SKQLLAEESL PTTPFYFILG KHRQQQDEKL NETLENELVQ721 LPLTENIPAI SELLHTPAHV LPSAAFLCSM FVNSLLLSKE TKSAKEIPED VDMEEEKESE781 DSDEENDFTE KVQDTSNTGL GEDIIHQLSK SEEKELRKFR KIDYSWIAAL 

Estructura secundaria

Se predice [4] que la estructura secundaria contiene conjuntos alternados de hélices alfa y cadenas beta. No se predijo la presencia de regiones hélice-giro-hélice (HTH).

Homología

No existen parálogos conocidos para el gen humano . No se encontraron parálogos para los ortólogos de vaca, ratón o rata de WDR75. [5] La conservación entre los ortólogos de mamíferos para el gen humano fue fuerte, con una identidad mínima entre ortólogos del 76%. La siguiente tabla resume algunos ortólogos de vertebrados e invertebrados. La conservación de aminoácidos específicos de las posiciones 340-390, 430-450 y 515-530 se correlaciona con las hélices alfa predichas. [4]

Referencias

  1. ^ ab "Entrez Gene:WDR75 WD repeat domain 75" (Gen Entrez:WDR75 dominio de repetición WD 75) . Consultado el 3 de mayo de 2009 .
  2. ^ "BLAST" . Consultado el 6 de mayo de 2009 .
  3. ^ "CDD: Base de datos de dominios conservados y clasificación de proteínas".
  4. ^ abc Banco de trabajo de biología SDSC 2.0
  5. ^ "BLAT Search Genome" (Búsqueda Genómica BLAT) . Consultado el 7 de mayo de 2009 .
  6. ^ "Proteína 75 que contiene repeticiones WD [Bos taurus] - Proteína - NCBI".
  7. ^ "Proteína 75 que contiene repeticiones WD [Mus musculus] - Proteína - NCBI".
  8. ^ "Proteína 75 que contiene repeticiones WD [Pan troglodytes] - Proteína - NCBI".
  9. ^ "Proteína 75 que contiene repeticiones WD [Rattus norvegicus] - Proteína - NCBI".
  10. ^ "Proteína 75 que contiene repeticiones WD [Canis lupus familiaris] - Proteína - NCBI".
  11. ^ "Proteína 75 que contiene repeticiones WD [Xenopus laevis] - Proteína - NCBI".
  12. ^ "PREDECIDO: proteína 75 que contiene repeticiones WD [Gallus gallus] - Proteína - NCBI".
  13. ^ "Proteína asociada a U3 snoRNP Nan1 [Schizosaccharomyces pombe 972h-] - Proteína - NCBI".
  14. ^ "AGAP007948-PA, parcial [Anopheles gambiae STR. PEST] - Proteína - NCBI".