La Vuelta al País Vasco 2006 fue la 46.ª edición de la Vuelta al País Vasco en bicicleta de ruta y se celebró en seis etapas entre el 3 y el 8 de abril de 2006. [2] Fue ganada por el español José Ángel Gómez Marchante del equipo ciclista Saunier Duval–Prodir .
3 de abril de 2006: Irún a Irún, 130 km (81 millas)
4 de abril de 2006: Irún a Segura , 155 km (96 millas)
5 de abril de 2006 – Segura a Lerín , 170 km (110 millas)
6 de abril de 2005: Lerín a Vitoria-Gasteiz , 172 km (107 millas)
7 de abril de 2006 – Vitoria-Gasteiz a Zalla , 178 km (111 millas)
8 de abril de 2006: Zalla a Zalla, 24 km (15 millas) ( ITT )
Esta etapa fue una contrarreloj individual .