Lipothrixviridae es una familia de virus del orden Ligamenvirales . Las arqueas termófilas del filo Thermoproteota sirven como hospedadores naturales. Hay 11 especies en esta familia, asignadas a 4 géneros. [1] [2] [3] [4] [5]
Los siguientes géneros y especies están asignados a la familia: [2]
La familia consta de tres géneros: Alphalipothrixvirus , Betalipothrixvirus y Deltalipothrixvirus . Captovirus solía estar en esta familia como el género Gammalipothrixvirus, pero ahora es el único género de la familia Ungulaviridae . [6] [7] Se clasifican en géneros según sus propiedades genómicas y la diversidad de sus apéndices terminales, que participan en el reconocimiento de la célula huésped. El género Alphalipothrixvirus propuesto originalmente pasó a llamarse Alphatristromavirus y se trasladó a la familia Tristromaviridae . [8] [9] En 2020, el género Alphalipothrixvirus se recreó para la clasificación del virus filamentoso de Sulfolobus 1 [10] y el virus filamentoso de Sulfolobales Beppu 2. [11]
En el género Gammalipothrixvirus se encuentran estructuras similares a garras en cada extremo del virión.
Los miembros de Lipothrixviridae comparten características estructurales y genómicas con los virus de la familia Rudiviridae , que contiene virus con forma de bastón sin envoltura. Los virus de las dos familias tienen genomas de dsADN lineales y comparten hasta nueve genes. Además, las partículas filamentosas de los rudivirus y lipothrixvirus están formadas por proteínas de la cápside principal homólogas y estructuralmente similares. Debido a estas propiedades compartidas, los virus de las dos familias se clasifican en un orden Ligamenvirales . [12]
Los miembros de Ligamenvirales están estructuralmente relacionados con los virus de la familia Tristromaviridae que, de manera similar a los lipothrixvirus, tienen envoltura y codifican dos proteínas de cápside principales parálogas con el mismo plegamiento que las de los ligamenvirus. [13] Debido a estas similitudes estructurales, se propuso que el orden Ligamenvirales y la familia Tristromaviridae se unificaran dentro de una clase 'Tokiviricetes' (toki significa 'hilo' en georgiano y viricetes es un sufijo oficial para una clase de virus). [13]
Los virus tienen una envoltura y son filamentosos. La cápside varía considerablemente en longitud (410–1950 nanómetros (nm)) y tiene un diámetro de 24–38 nm. La envoltura tiene una estructura monocapa e incluye lípidos de tetraéteres de di-fitanilo. [ cita requerida ]
Desde cada extremo del virón hay protuberancias que se extienden desde el núcleo a través de la envoltura. La cápside en sí es alargada y presenta simetría helicoidal. El núcleo en sí es helicoidal. [ cita requerida ]
Existen dos proteínas principales de la cápside (MCP1 y MCP2). MCP1 y MCP2 forman un heterodímero que envuelve el genoma de dsADN lineal y lo transforma en la forma A. La interacción entre el genoma y las MCP conduce a la condensación del genoma en la superhélice del virión. [10] [14] [15] Los genomas son lineales y tienen una longitud de hasta 40 kb. [1]
La replicación viral es citoplasmática. La entrada en la célula huésped se logra por adsorción a la célula huésped. Se descubrió que el virus filamentoso de Acidianus 1 se une a apéndices celulares similares a pili. La transcripción basada en ADN es el método de transcripción. Las arqueas sirven como huésped natural. Las vías de transmisión son la difusión pasiva. [1]
En el caso del virus filamentoso Sulfolobus islandicus (SIFV), se ha estudiado el ensamblaje y la salida de los viriones. Los viriones se ensamblan dentro de la célula. La unión de los dímeros de la proteína de la cápside principal al genoma de dsADN lineal conduce al ensamblaje de las nucleocápsides, que posteriormente se envuelven intracelularmente a través de un mecanismo desconocido. [16] Es probable que todos los lipothrixvirus sean virus líticos. En el caso de los betalipothrixvirus y deltalipothrixvirus, los viriones se liberan a través de portales piramidales, denominados pirámides asociadas al virus (VAP). Las VAP del SIFV tienen una base hexagonal (es decir, están construidas a partir de seis facetas triangulares). [16]