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Virus de lipothrix

Lipothrixviridae es una familia de virus del orden Ligamenvirales . Las arqueas termófilas del filo Thermoproteota sirven como hospedadores naturales. Hay 11 especies en esta familia, asignadas a 4 géneros. [1] [2] [3] [4] [5]

Taxonomía

Los siguientes géneros y especies están asignados a la familia: [2]

La familia consta de tres géneros: Alphalipothrixvirus , Betalipothrixvirus y Deltalipothrixvirus . Captovirus solía estar en esta familia como el género Gammalipothrixvirus, pero ahora es el único género de la familia Ungulaviridae . [6] [7] Se clasifican en géneros según sus propiedades genómicas y la diversidad de sus apéndices terminales, que participan en el reconocimiento de la célula huésped. El género Alphalipothrixvirus propuesto originalmente pasó a llamarse Alphatristromavirus y se trasladó a la familia Tristromaviridae . [8] [9] En 2020, el género Alphalipothrixvirus se recreó para la clasificación del virus filamentoso de Sulfolobus 1 [10] y el virus filamentoso de Sulfolobales Beppu 2. [11]

En el género Gammalipothrixvirus se encuentran estructuras similares a garras en cada extremo del virión.

Los miembros de Lipothrixviridae comparten características estructurales y genómicas con los virus de la familia Rudiviridae , que contiene virus con forma de bastón sin envoltura. Los virus de las dos familias tienen genomas de dsADN lineales y comparten hasta nueve genes. Además, las partículas filamentosas de los rudivirus y lipothrixvirus están formadas por proteínas de la cápside principal homólogas y estructuralmente similares. Debido a estas propiedades compartidas, los virus de las dos familias se clasifican en un orden Ligamenvirales . [12]

Los miembros de Ligamenvirales están estructuralmente relacionados con los virus de la familia Tristromaviridae que, de manera similar a los lipothrixvirus, tienen envoltura y codifican dos proteínas de cápside principales parálogas con el mismo plegamiento que las de los ligamenvirus. [13] Debido a estas similitudes estructurales, se propuso que el orden Ligamenvirales y la familia Tristromaviridae se unificaran dentro de una clase 'Tokiviricetes' (toki significa 'hilo' en georgiano y viricetes es un sufijo oficial para una clase de virus). [13]

Virología

Los virus tienen una envoltura y son filamentosos. La cápside varía considerablemente en longitud (410–1950 nanómetros (nm)) y tiene un diámetro de 24–38 nm. La envoltura tiene una estructura monocapa e incluye lípidos de tetraéteres de di-fitanilo. [ cita requerida ]

Desde cada extremo del virón hay protuberancias que se extienden desde el núcleo a través de la envoltura. La cápside en sí es alargada y presenta simetría helicoidal. El núcleo en sí es helicoidal. [ cita requerida ]

Existen dos proteínas principales de la cápside (MCP1 y MCP2). MCP1 y MCP2 forman un heterodímero que envuelve el genoma de dsADN lineal y lo transforma en la forma A. La interacción entre el genoma y las MCP conduce a la condensación del genoma en la superhélice del virión. [10] [14] [15] Los genomas son lineales y tienen una longitud de hasta 40 kb. [1]

Ciclo vital

La replicación viral es citoplasmática. La entrada en la célula huésped se logra por adsorción a la célula huésped. Se descubrió que el virus filamentoso de Acidianus 1 se une a apéndices celulares similares a pili. La transcripción basada en ADN es el método de transcripción. Las arqueas sirven como huésped natural. Las vías de transmisión son la difusión pasiva. [1]

En el caso del virus filamentoso Sulfolobus islandicus (SIFV), se ha estudiado el ensamblaje y la salida de los viriones. Los viriones se ensamblan dentro de la célula. La unión de los dímeros de la proteína de la cápside principal al genoma de dsADN lineal conduce al ensamblaje de las nucleocápsides, que posteriormente se envuelven intracelularmente a través de un mecanismo desconocido. [16] Es probable que todos los lipothrixvirus sean virus líticos. En el caso de los betalipothrixvirus y deltalipothrixvirus, los viriones se liberan a través de portales piramidales, denominados pirámides asociadas al virus (VAP). Las VAP del SIFV tienen una base hexagonal (es decir, están construidas a partir de seis facetas triangulares). [16]

Referencias

  1. ^ abc "Viral Zone". ExPASy . Consultado el 15 de junio de 2015 .
  2. ^ ab "Taxonomía de virus: publicación de 2020". Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV). Marzo de 2021. Consultado el 14 de mayo de 2021 .
  3. ^ Arnold, HP, Zillig, W., Ziese, U., Holz, I., Crosby, M., Utterback, T., Weidmann, JF, Kristjanson, JK, Klenk, HP, Nelson, KE y Fraser, CM (2000). Un nuevo lipothrixvirus, SIFV, del crenarqueón extremadamente termófilo Sulfolobus. Virology, 267, 252–266.
  4. ^ Janekovic, D., Wunderl S, Holz I, Zillig W, Gierl A, Neumann H (1983) TTV1, TTV2 y TTV3, una familia de virus de la arqueobacteria extremadamente termófila, anaeróbica y reductora de azufre Thermoproteus tenax. Mol. Gen. Genet. 19239–19245
  5. ^ Bettstetter, M., Peng, X., Garrett, RA y Prangishvili, D. (2003). AFV-1, un nuevo virus que infecta arqueas hipertermófilas del género Acidianus. Virology, 315, 68–79.
  6. ^ "Publicación actual de la taxonomía ICTV | ICTV".
  7. ^ Häring M, Vestergaard G, Brügger K, Rachel R, Garrett RA, Prangishvili D (2005) Estructura y organización del genoma de AFV2, un nuevo lipothrixvirus arqueal con estructuras terminales y centrales inusuales. J Bacteriol 187(11): 3855–3858 doi :10.1128/JB.187.11.3855-3858.2005
  8. ^ Prangishvili, D; Rensen, E; Mochizuki, T; Krupovic, M; Informe ICTV, Consorcio (febrero de 2019). "Perfil de taxonomía del virus ICTV: Tristromaviridae". Revista de Virología General . 100 (2): 135–136. doi : 10.1099/jgv.0.001190 . PMID  30540248.
  9. ^ "Informe del ICTV sobre Tristromaviridae".
  10. ^ ab Liu, Y; Osinski, T; Wang, F; Krupovic, M; Schouten, S; Kasson, P; Prangishvili, D; Egelman, EH (2018). "Conservación estructural en un virus filamentoso con envoltura de membrana que infecta a un acidófilo hipertermófilo". Nature Communications . 9 (1): 3360. Bibcode :2018NatCo...9.3360L. doi :10.1038/s41467-018-05684-6. PMC 6105669 . PMID  30135568. 
  11. ^ Liu, Y; Brandt, D; Ishino, S; Ishino, Y; Koonin, EV; Kalinowski, J; Krupovic, M; Prangishvili, D (2019). "Nuevos virus arqueológicos descubiertos mediante análisis metagenómico de comunidades virales en cultivos de enriquecimiento". Microbiología ambiental . 21 (6): 2002–2014. Bibcode :2019EnvMi..21.2002L. doi :10.1111/1462-2920.14479. PMC 11128462 . PMID  30451355. S2CID  53950297. 
  12. ^ Prangishvili D, Krupovic M (2012). "Un nuevo taxón propuesto para virus de ADN bicatenario, el orden "Ligamenvirales"". Arch Virol . 157 (4): 791–795. doi : 10.1007/s00705-012-1229-7 . PMID  22270758.
  13. ^ ab Wang, Fengbin; Baquero, Diana P; Su, Zhangli; Osinski, Tomasz; Prangishvili, David; Egelman, Edward H; Krupovic, Mart (2020). "La estructura de un virus filamentoso descubre vínculos familiares dentro de la virósfera de las arqueas". Evolución de los virus . 6 (1): veaa023. doi :10.1093/ve/veaa023. PMC 7189273 . PMID  32368353. 
  14. ^ Kasson, P; DiMaio, F; Yu, X; Lucas-Staat, S; Krupovic, M; Schouten, S; Prangishvili, D; Egelman, EH (2017). "Modelo para una nueva envoltura de membrana en un virus filamentoso hipertermofílico". eLife . 6 : e26268. doi : 10.7554/eLife.26268 . PMC 5517147 . PMID  28639939. 
  15. ^ Wang, F; Baquero, DP; Beltran, LC; Su, Z; Osinski, T; Zheng, W; Prangishvili, D; Krupovic, M; Egelman, EH (2020). "Las estructuras de los virus filamentosos que infectan arqueas hipertermófilas explican la estabilización del ADN en entornos extremos". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 117 (33): 19643–19652. Bibcode :2020PNAS..11719643W. doi : 10.1073/pnas.2011125117 . PMC 7443925 . PMID  32759221. 
  16. ^ ab Baquero, DP; Gazi, AD; Sachse, M; Liu, J; Schmitt, C; Moya-Nilges, M; Schouten, S; Prangishvili, D; Krupovic, M (2021). "Un virus filamentoso de arqueas se envuelve dentro de la célula y se libera a través de portales piramidales". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 118 (32): e2105540118. Bibcode :2021PNAS..11805540B. doi : 10.1073/pnas.2105540118 . PMC 8364153 . PMID  34341107. 

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