Tombusvirus 5 ′ UTR es una importante región reguladora cis del genoma del virus Tombus .
El virus del achaparramiento del tomate es el miembro prototipo de la familia Tombusviridae . El genoma de este virus es ARN monocatenario de sentido positivo . La replicación se produce a través de un intermediario de ARN de cadena negativa. Además de las proteínas virales p33 y la ARN polimerasa p92 dependiente de ARN, y factores desconocidos del huésped, las regiones conservadas y estructurales dentro de la región 5' no traducida (5' UTR) son importantes para regular la replicación del genoma. [ cita necesaria ]
Se han informado 2 dominios de ARN en la UTR 5', un dominio en forma de T (TSD) en 5' seguido de un bucle de tallo (SL5) [1] [2] y un dominio aguas abajo (DSD). [3] Se propone que las interacciones TSD-DSD estén involucradas en la mediación de la replicación del ARN viral. [3]
Una característica interesante del Tombusvirus es su capacidad para apoyar la replicación de ARN de interferencia (DI) defectuosos. Estos replicones subvirales son pequeños mutantes de deleción no codificantes del genoma viral que mantienen los elementos de ARN que actúan en cis necesarios para la replicación [1]
Otras estructuras de ARN no codificantes en Tombusvirus incluyen la región IV 3' UTR [4] y un elemento de replicación interno . [5]
Referencias
- ^ ab Wu B, Vanti WB, White KA (2001). "Un dominio de ARN dentro de la región 5 'no traducida del genoma del virus del atrofia tupida del tomate modula la replicación del ARN viral". J. Mol. Biol . 305 (4): 741–756. doi :10.1006/jmbi.2000.4298. PMID 11162089.
- ^ Ray D, Na H, White KA (2004). "Propiedades estructurales de un dominio de ARN multifuncional en forma de T que media la replicación eficiente del ARN del virus del atrofia tupida del tomate". J. Virol . 78 (19): 10490–10500. doi :10.1128/JVI.78.19.10490-10500.2004. PMC 516415 . PMID 15367615.
- ^ ab Ray D, Wu B, White KA (2003). "Un segundo dominio de ARN funcional en la UTR 5 ′ del genoma del virus del atrofia tupida del tomate: las interacciones intra e interdominio median la replicación del ARN viral". ARN . 9 (10): 1232-1245. doi :10.1261/rna.5630203. PMC 1370487 . PMID 13130137.
- ^ Fabián MR, Na H, Ray D, White KA (2003). "Las estructuras secundarias de ARN 3′-terminal son importantes para la acumulación de ARN DI del virus del atrofia tupida del tomate". Virología . 313 (2): 567–580. doi : 10.1016/S0042-6822(03)00349-0 . PMID 12954222.
- ^ Monkewich, S; LinHX; Fabián MR; Xu W; NaH; Rayo D; Chernysheva OA; Departamento de Policía de Nagy; Blanco KA (2005). "La región codificante de la polimerasa p92 contiene un elemento de ARN interno necesario en un paso inicial de la replicación del genoma del Tombusvirus". J Virol . 79 (8): 4848–4858. doi :10.1128/JVI.79.8.4848-4858.2005. PMC 1069561 . PMID 15795270.
enlaces externos
- Página para Tombusvirus 5′ UTR en Rfam
