Valdemar VI, príncipe de Anhalt-Köthen (1450 – Köthen , 1 de noviembre de 1508), fue un príncipe alemán de la Casa de Ascania y gobernante del principado de Anhalt-Köthen .
Era el hijo mayor del Príncipe Jorge I de Anhalt-Dessau y de su segunda esposa, Sofía, posiblemente miembro de la Casa de Hohnstein .
En 1471, su padre firmó un contrato de sucesión con el príncipe Adolfo I de Anhalt-Köthen . Según los términos de este contrato, Jorge I de Anhalt-Dessau asumió el gobierno de la mitad del principado de Anhalt-Köthen y se convirtió en cogobernante con Adolfo como "Mitherr". Poco después, Jorge renunció a sus derechos en favor de Valdemar, quien se convirtió en el nuevo cogobernante con Adolfo I.
Adolfo I murió dos años después, en 1473, y Valdemaro tuvo que gobernar conjuntamente con su medio hermano y heredero, Alberto VI . El nuevo príncipe Alberto murió quince meses después y fue sucedido por su hijo Felipe . A la muerte de Alberto VI, dos hijos de Adolfo I, Magnus y Adolfo II , fueron incluidos en el gobierno del principado.
Durante su vida, Waldemar también asumió los siguientes títulos: "Señor de Köthen" (en 1480), "Señor de Hoym" (en 1492) y "Señor de Burgscheidungen" (en 1496).
Felipe murió sin descendencia en 1500 y los hijos de Adolfo I renunciaron formalmente a sus derechos de gobernar el principado ocho años más tarde. En consecuencia, Valdemar se convirtió en el único gobernante de Anhalt-Köthen, pero gozó de este estatus sólo durante unos pocos meses durante el año 1508.
A su muerte, le sucedió su único hijo sobreviviente, Wolfgang .
El 24 de enero de 1485, Valdemar se casó en Köthen con Margarita (n. Rudolstadt, 16 de junio de 1464 - m. Köthen, 1 de agosto de 1539), hija de Gunther XXXVI, conde de Schwarzburgo y señor de Arnstedt. Tuvieron cuatro hijos: