El equipo de fútbol americano Wyoming Cowboys de 1999 representó a la Universidad de Wyoming en la temporada de fútbol americano de la División IA de la NCAA de 1999. La ofensiva de los Cowboys anotó 302 puntos, mientras que la defensa permitió 270 puntos. A pesar de un récord ganador, los Cowboys no fueron invitados a jugar en un partido de bowl.
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