Undecaprenil-difosfatasa

Clase de enzimas

En enzimología , una undecaprenil-difosfatasa ( EC 3.6.1.27) es una enzima que cataliza la reacción química

difosfato de undecaprenilo + H ₂ O fosfato de undecaprenilo + fosfato ${\displaystyle \rightleftharpoons }$

Así, los dos sustratos de esta enzima son el difosfato de undecaprenilo y el _H2O , mientras que sus dos productos son el fosfato de undecaprenilo y el fosfato . La actividad enzimática se ve potenciada por los cationes divalentes, en particular el Ca2 ⁺ .

En muchas bacterias, esta enzima es una proteína de membrana que participa en la biosíntesis de peptidoglicano . Se la ha relacionado con la resistencia al antibiótico bacitracina . ^[1]

Nomenclatura

Esta enzima pertenece a la familia de las hidrolasas , específicamente aquellas que actúan sobre anhídridos de ácido en anhídridos que contienen fósforo. El nombre sistemático de esta clase de enzimas es undecaprenil-difosfato fosfohidrolasa. Otros nombres de uso común incluyen undecaprenil-pirofosfato fosfatasa (Uppp), fosfatasa UPP, BacA, C55-isoprenil difosfatasa, C55-isoprenil pirofosfatasa y isoprenil pirofosfatasa. ^[2]

Nota: La enzima Uppp/BacA (EC 3.6.1.27) ha sido denominada incorrectamente en ocasiones como " undecaprenol quinasa ". ^[3] Sin embargo, ese nombre debería reservarse para una enzima distinta (EC 2.7.1.66), que cataliza la adición de un grupo fosfato de ATP al undecaprenol (alcohol isoprenílico C55).

Estructura

Las estructuras cristalinas de rayos X de la forma de membrana de la enzima de E. coli ^{[4] [5]} están disponibles (PDB IDs: 5OON, ^[6] 6CB2 ^[7] ).

Referencias

1. Chalker AF, Ingraham KA, Lunsford RD, Bryant AP, Bryant J, Wallis NG, Broskey JP, Pearson SC, Holmes DJ (julio de 2000). "El gen bacA, que determina la susceptibilidad a la bacitracina en Streptococcus pneumoniae y Staphylococcus aureus, también es necesario para la virulencia". Microbiología . 146 (Pt 7): 1547–53. doi : 10.1099/00221287-146-7-1547 . PMID  10878119.
2. "undecaprenyl diphosphate (YMDB00637) - Base de datos del metaboloma de la levadura" www.ymdb.ca . Consultado el 7 de septiembre de 2023 .
3. El Ghachi M, Bouhss A, Blanot D, Mengin-Lecreulx D (julio de 2004). "El gen bacA de Escherichia coli codifica una actividad de fosfatasa de pirofosfato de undecaprenilo". The Journal of Biological Chemistry . 279 (29): 30106–13. doi : 10.1074/jbc.M401701200 . PMID  15138271.
4. El Ghachi M, Howe N, Huang CY, Olieric V, Warshamanage R, Touzé T, Weichert D, Stansfeld PJ, Wang M, Kerff F, Caffrey M (marzo de 2018). "Estructura cristalina de la fosfatasa de undecaprenil-pirofosfato y su papel en la biosíntesis de peptidoglicano". Nature Communications . 9 (1): 1078. doi :10.1038/s41467-018-03477-5. PMC 5852022 . PMID  29540682. 
5. Workman SD, Worrall LJ, Strynadka NC (marzo de 2018). "Estructura cristalina de una fosfatasa intramembranal fundamental para la biosíntesis de peptidoglicano de la pared celular bacteriana y el reciclaje de lípidos". Nature Communications . 9 (1): 1159. doi :10.1038/s41467-018-03547-8. PMC 5861054 . PMID  29559664. 
6. "5OON - Estructura de la fosfatasa de undecaprenil-pirofosfato, BacA". Banco de datos de proteínas RCSB .
7. "6CB2 - Estructura cristalina de Escherichia coli UppP". Banco de datos de proteínas RCSB .

Lectura adicional

• Goldman R, Strominger JL (agosto de 1972). "Purificación y propiedades de la fosfatasa de C 55 -isoprenilpirofosfato de Micrococcus lysodeikticus". Revista de química biológica . 247 (16): 5116–22. PMID  4341539.