El ARNpn U11 ( ácido ribonucleico nuclear pequeño ) es un ARN no codificante importante en el complejo proteico del espliceosoma menor , que activa el mecanismo de empalme alternativo . El espliceosoma menor está asociado con componentes proteicos similares a los del espliceosoma mayor . Utiliza el ARNpn U11 para reconocer el sitio de empalme 5' (funcionalmente equivalente al ARNpn U1 ), mientras que el ARNpn U12 se une al punto de ramificación para reconocer el sitio de empalme 3' (funcionalmente equivalente al ARNpn U2 ). [1]
El ARNm U11 tiene una estructura de tallo-bucle con un extremo 5' como secuencia de sitio de empalme (5' ss) [2] y contiene cuatro estructuras de tallo-bucle (I-IV). Una comparación estructural del ARNm U11 entre plantas, vertebrados e insectos muestra que está plegado en una estructura con una unión de cuatro vías en el sitio 5' y en una estructura de tallo-bucle en el sitio 3'. [3]
La región del sitio de empalme 5' posee complementariedad de secuencia con el sitio de empalme 5' de los intrones del pre-ARNm tipo U12 eucariota . Tanto el sitio de empalme 5' como el sitio de unión de Sm están altamente conservados en todas las especies. [3] Además, el tallo bucle III es un posible sitio de unión de proteínas o una región de apareamiento de bases ya que tiene una secuencia de nucleótidos altamente conservada 'AUCAAGA'. [3]
Los snRNP U11 y U12 (vía espliceosómica menor) son análogos funcionales de los snRNP U1 y U2 (vía espliceosómica mayor), mientras que los snRNP U4 atac / U6 atac son similares a los U4 / U6 . A diferencia de la vía de empalme mayor, los snRNP U11 y U12 se unen al ARNm como un complejo di-snRNP U11/U12 preformado y estable. Esto se hace mediante el uso de siete proteínas (65K, 59K, 48K, 35K, 31K, 25K y 20K). Cuatro de ellas (59K, 48K, 35K y 25K) están asociadas con el snRNA U11. [4]
Durante la formación del espliceosoma, el extremo 5' de los snRNA U11 y U12 interactúan con el sitio de empalme 5' y la secuencia del punto de ramificación del ARNm respectivamente, a través del apareamiento de bases. [4] [5] El snRNP U11 se une a una repetición en tándem conocida como potenciador de empalme de unión a snRNP U11 (USSE) e inicia el proceso de empalme. [6] Dado que los snRNA U11 y U12 se unen como un bicomplejo, forman un puente molecular entre dos extremos de intrones en el complejo prespliceosoma. [4] Las proteínas U11-48K y U11/U12-65K reconocen el sitio de empalme del intrón de tipo U12 y estabilizan el bicomplejo U11/U12. [6] Después de activar el complejo espliceosoma, el snRNA U11 abandona el ensamblaje.
Este tipo de reconocimiento del sitio de empalme 5' y la unión de intrones a través de interacciones proteína-proteína , proteína-ARN y ARN-ARN es único en el complejo espliceosómico menor, a diferencia del espliceosómico mayor. [4] Dado que el empalme alternativo es la clave para la variación de la expresión génica (ARNm) que codifica las proteínas, U11 es crucial para este proceso regulador y responsable de la formación de un acervo proteómico . Por lo tanto, el ARNp U11 es importante en términos de aspectos evolutivos. [7]