Tom Knight es un biólogo sintético e ingeniero informático estadounidense , que anteriormente fue científico investigador senior en el Laboratorio de Ciencias de la Computación e Inteligencia Artificial del MIT , una parte de la Escuela de Ingeniería del MIT . [1] Ahora trabaja en la empresa de biología sintética Ginkgo Bioworks , que cofundó en 2008.
Tom Knight llegó al MIT cuando tenía catorce años. [2] Aunque sólo comenzó sus estudios universitarios a la edad normal de 18 años, tomó clases de programación informática y química orgánica durante la escuela secundaria porque vivía cerca de la universidad. [3] Construyó hardware temprano como las interfaces ARPANET para el host #6 en la red, algunas de las primeras pantallas de mapa de bits , el sistema de tiempo compartido ITS , máquinas Lisp (también fue instrumental en el lanzamiento de una versión del sistema operativo para la máquina Lisp bajo una licencia BSD ), la Connection Machine y sistemas informáticos de procesamiento simbólico paralelo.
En 1967, Knight escribió el núcleo original para el sistema operativo ITS , así como la combinación de procesador de comandos y depurador que se utilizó como su interfaz de usuario de nivel superior. ITS fue el sistema operativo dominante primero para el Proyecto MAC y luego para el Laboratorio de Inteligencia Artificial del MIT y el Laboratorio de Ciencias de la Computación del MIT . ITS se ejecutó en computadoras PDP-6 y, más tarde, PDP-10.
En 1968, Knight diseñó y supervisó la construcción de las primeras interfaces ARPANET PDP-10 con Bob Metcalfe .
Knight desarrolló un sistema para utilizar televisores estándar como interfaz de terminal para el PDP-10.
En 1972, Knight diseñó una de las primeras pantallas de mapa de bits basadas en memoria de semiconductores. Esta pantalla se comercializó posteriormente y condujo directamente al desarrollo del sistema de diseño de periódicos de Bedford Computer Systems e influyó en muchos de los dispositivos de visualización de mapa de bits disponibles en la actualidad. Ese mismo año, junto con Jeff Rubin, Knight diseñó e implementó un sistema de archivos de red que proporcionó el primer acceso remoto transparente a archivos a través de ARPANET.
En 1974, Knight diseñó e implementó la versión prototipo del procesador MIT Lisp Machine , y la versión de producción se lanzó en 1976. Lisp Machine era una máquina microprogramada, optimizada para la emulación de alto rendimiento de otros conjuntos de instrucciones. El diseño de Lisp Machine fue implementado directamente por Symbolics y LMI y fue la base de todas sus computadoras. Texas Instruments implementó versiones de la arquitectura de montaje superficial y de chip único en 1983 y 1987, respectivamente.
Knight colaboró con Jack Holloway en el diseño e implementación de Chaosnet , una versión rediseñada de la Ethernet de 3 Mbit/s de Xerox . En 1975, esta red se convirtió en la primera red de área local del campus del MIT. La innovación de Chaosnet de una cadena de bits de preámbulo para los paquetes se incorporó finalmente al estándar Ethernet de 10 Mbit/s.
En 1980, Knight participó en el desarrollo de la arquitectura Connection Machine y su implementación original. Otros logros notables y diversos durante la década de 1980 incluyeron la creación de la primera retina de silicio en 1981, la creación de un ratón óptico de un solo chip, el diseño de la arquitectura de red de interconexión Cross-Omega y el diseño de la arquitectura de interconexión de multiprocesadores Transit.
A principios de los años 90, Knight participó en la formación de Permabit y de Exa Corporation , así como en la arquitectura de la versión inicial de esta última de su computadora de flujo de fluido paralelo de gas en red FX/1. Los avances incluyeron el uso de técnicas de sobre-relajación para lograr mejoras algorítmicas de 10x en los cálculos de gas en red, precisiones de CFD históricas y la corrección de conceptos erróneos sobre el origen de la turbulencia de fluidos en situaciones de flujo bidimensional simple. Dentro del Laboratorio de Inteligencia Artificial, dirigió el proyecto Abacus SIMD, trabajó en micropantallas VLSI e hizo avances en el campo de la computación adiabática (reversible) .
Fue también durante este período que comenzaron los intereses de Knight en los sistemas biológicos. Inspirado en parte por el trabajo de Harold J. Morowitz , un físico y biólogo de Yale, Knight estudió bioquímica, genética y biología celular, y estableció un laboratorio de biología dentro del Laboratorio de IA del MIT . En este laboratorio creó el concepto de la parte de ADN plasmídico BioBrick [4] y comenzó a crear una biblioteca de BioBricks que podrían usarse para simplificar la ingeniería genética de las células de Escherichia coli . Hoy, los BioBricks forman la base de la enorme competencia anual iGEM (International Genetically Engineered Machine) [2] y a veces se hace referencia a Knight como el padrino de la biología sintética. [5] Knight cofundó Ginkgo Bioworks , una empresa de biología sintética.