Thomas Holenstein (7 de febrero de 1896 - 31 de octubre de 1962) fue un político suizo y miembro del Consejo Federal Suizo (1955-1959).
Holenstein estudió derecho en la Universidad de Berna y lo terminó en 1920. Luego trabajó como abogado en el despacho de su padre en St. Gallen .
Políticamente, estaba afiliado al Partido Popular Demócrata Cristiano de Suiza . De 1930 a 1935 fue presidente del joven movimiento conservador del cantón de San Galo . Fue elegido miembro del parlamento de la ciudad de St. Gallen en 1927. De 1936 a 1954, Holenstein sirvió en el parlamento del cantón y de 1937 a 1954 representó a su cantón en el Consejo Nacional de Suiza . También fue presidente del Partido Parlamentario de 1942 a 1954 y presidente del Consejo Nacional en 1952.
Fue elegido miembro del Consejo Federal de Suiza el 16 de diciembre de 1954. Durante su mandato dirigió el Departamento Federal de Asuntos Económicos y fue Presidente de la Confederación en 1958. Dimitió el 20 de noviembre de 1959 por motivos de salud y entregó el cargo. el 31 de diciembre de 1959.