Templo F. Smith

académico americano

Temple Ferris Smith (nacido el 7 de marzo de 1939) es un profesor emérito de ingeniería biomédica ^{[4] [5]} que ayudó a desarrollar el algoritmo Smith-Waterman con Michael Waterman en 1981. ^[3] El algoritmo Smith-Waterman sirve como base para comparaciones de múltiples secuencias, identificando el segmento con la máxima similitud de secuencia local, véase alineamiento de secuencias . Este algoritmo se utiliza para identificar segmentos similares de ADN , ARN y proteínas . Fue director ^{[ ¿cuándo? ]} del Centro de Investigación de Ingeniería Biomolecular ^[4] en la Universidad de Boston durante veinte años y ahora es ^{[¿ cuándo? ]} profesor emérito .

Educación

Smith obtuvo su licenciatura en 1963 en el Departamento de Física de la Universidad de Purdue , seguido de un doctorado en 1969 en el Departamento de Física de la Universidad de Colorado en Boulder . ^[6]

Investigación y carrera

Después de su doctorado, Smith realizó una investigación postdoctoral desde marzo de 1969 hasta agosto de 1971 en el Departamento de Biofísica y Genética de la Facultad de Medicina de la Universidad de Colorado, en Boulder. ^{[ cita requerida ]}

Su investigación se centra en la aplicación de diversos métodos informáticos y matemáticos para el descubrimiento de patrones sintácticos y semánticos en secuencias de ácidos nucleicos y aminoácidos. En los últimos años se ha centrado en la evolución molecular de familias de proteínas, como las hélices beta de repetición WD, la GTPasa asociada a la traducción y las proteínas ribosómicas. ^[7] Es conocido por la creación del algoritmo Smith-Waterman . ^[3]

Smith ha ocupado los siguientes cargos:

• 1965–1966: Instructor , Fuerza Aérea de EE. UU., Lowery, Denver, Colorado
• 1971–1984: Profesor , Departamento de Física, Northern Michigan University, Marquette, MI
• 1985–1991: Director , Recursos informáticos de investigación en biología molecular, Instituto de Cáncer Dana-Farber, Facultad de Medicina de Harvard y Facultad de Salud Pública de Harvard
• 1991–2009: Director , Centro de recursos de ingeniería biomolecular, Universidad de Boston
• 1999– : Coorganizador , Día del descubrimiento de la biotecnología del Instituto para el avance académico de la juventud de 1999
• 2000– : Cofundador y director de información , Modular Genetics, Inc.
• 2000– : Entrenador de hockey juvenil ^{[ cita requerida ]}

Publicaciones seleccionadas

• M. Mariotti, TF Smith, PH Sudmant y G. Goldberger, “La pseudogeneización de Lfg5 específico de los testículos es anterior a la divergencia entre humanos y neandertales”, Journal of Human Genetics 59, 288–291 (2014)
• Hyman Hartman y Temple F. Smith “La evolución del ribosoma y el código genético”, Life, 4(2), 227–249 (2014)
• Hartman, H y TF Smith, “GTPasas y el origen del ribosoma”, Biology Direct, 5:36-39, (2010)
• Hartman, Hyman y Smith, Temple F. “La evolución del cilio y la célula eucariota” Cell Motility and the Cytoskeleton.66: 215-219. (2009)
• Hu, Lan, Smith, Temple F. y Goldberger, Gabriel. “LFG: una familia de genes candidatos para la regulación de la apoptosis” Apoptosis. 14: 1255-1265. (2009)
• Smith, Temple F., Lee, Jung C., Gutell, Robin R. y Hartman, Hyman. “El origen y la evolución del ribosoma” Biology Direct 3: 16, 1–13 (2008)
• Smith, Temple F. “Capítulo 2: Diversidad de proteínas con repetición WD” La familia de proteínas Coronin, 20-30 (2008)
• Bhutkar, Arjun V., Gelbart, William M. y Smith, Temple F. (2007). Inferencia de la filogenia de la reorganización a escala del genoma y del orden genético ancestral: un estudio de caso de Drosophila. Genome Biology 8, R236
• Bhutkar, Arjun, Russo, Susan M., Smith, Temple F. y Gelbart, William M. “Análisis a escala genómica de genes reubicados posicionalmente” Genome Research 17: 1880-1887 (2007)
• Hartman, Hyman, Favaretto, Paola y Smith, Temple F. “Los orígenes arqueológicos del sistema de traducción eucariota” Archaea 2: 1-9 (2006)
• Bienkowska, Jadwiga, Hartman, Hyman y Smith, Temple F. (2003). ¿Un método de búsqueda de homólogos de proteínas pequeñas, proteínas similares a la ubiquitina en células procariotas? Ingeniería de proteínas 16 (12), 897–904.
• Venkatesan, Kavitha, McManus, Heather R., Mello, Craig C., Smith, Temple F. y Hansen, Ulla. (2003). Conservación funcional entre miembros de una antigua familia de factores de transcripción duplicados, LSF/Grainyhead. Nucleic Acids Research 31(15), 4304–4316.
• Zhang YX1, Fox JG, Ho Y, Zhang L, Stills HF Jr, Smith TF. Comparación del gen de la proteína principal de la membrana externa (MOMP) de las cepas de Chlamydia trachomatis de neumonitis de ratón (MoPn) y SFPD de hámster con otras cepas de Chlamydia. Mol Biol Evol. 1993 Nov;10(6):1327–42.
• Figge J, Smith TF. Motivo de secuencia de división celular. Nature 334 (6178), 109 (14 de julio de 1988) |pmid=3290690 |doi=10.1038/334109a0.

Premios y honores

Smith recibió el premio ISCB Senior Scientist Award ^[1] y fue elegido miembro de ISCB en 2009 por la Sociedad Internacional de Biología Computacional . ^[2]

En 2002, fue incluido en el Instituto Americano de Ingeniería Médica y Biológica (AIMBE) “por sus extraordinarias contribuciones en la definición y el avance del campo de la bioinformática, con énfasis en nuevos métodos de ingeniería para predecir la estructura y función de las proteínas”. ^{[ cita requerida ]}

Referencias

1. Maisel, M. (2007). "ISCB honra a Temple F. Smith y Eran Segal". PLOS Computational Biology . 3 (6): e128. Bibcode :2007PLSCB...3..128M. doi : 10.1371/journal.pcbi.0030128 . PMC  1904388 . PMID  17604447.
2. "ISCB Fellows". iscb.org . Sociedad Internacional de Biología Computacional . 2017. Archivado desde el original el 20 de marzo de 2017.
3. Smith, T.; Waterman, MS (1981). "Identificación de subsecuencias moleculares comunes". Revista de Biología Molecular . 147 (1): 195–197. CiteSeerX 10.1.1.63.2897 . doi :10.1016/0022-2836(81)90087-5. PMID  7265238. 
4. "Centro de investigación en ingeniería biomolecular | Universidad de Boston". Bmerc-www.bu.edu . Consultado el 24 de marzo de 2017 .
5. "Temple Smith". Archivado desde el original el 7 de julio de 2007. Consultado el 3 de mayo de 2007 .
6. Smith, Temple Ferris (1969). Las amplitudes de deuterones a partir de una teoría de dispersión nuclear de partículas compuestas (tesis doctoral). Universidad de Colorado en Boulder. OCLC  50252533. ProQuest  302393082.
7. "Temple F. Smith, Ph.D. » Microbiología » BUMC". Archivado desde el original el 4 de abril de 2012. Consultado el 28 de octubre de 2011 .