Templo F. Smith

académico americano

Temple Ferris Smith (nacido el 7 de marzo de 1939) es profesor emérito de ingeniería biomédica ^{[4] [5]} que ayudó a desarrollar el algoritmo Smith-Waterman con Michael Waterman en 1981. ^[3] El algoritmo Smith-Waterman sirve como base para comparaciones de secuencias múltiples, identificando el segmento con la máxima similitud de secuencia local, consulte alineación de secuencias . Este algoritmo se utiliza para identificar segmentos de ADN , ARN y proteínas similares . Fue director ^{[ ¿cuándo? ]} del Centro de Investigación de Ingeniería BioMolecular ^[4] de la Universidad de Boston durante veinte años y ahora es ^{[ ¿cuándo? ]} Profesor Emeritus .

Educación

Smith obtuvo su licenciatura en 1963 en el Departamento de Física de la Universidad Purdue , seguida de un doctorado en 1969 en el Departamento de Física de la Universidad de Colorado en Boulder . ^[6]

Investigación y carrera

Después de su doctorado, Smith realizó una investigación postdoctoral desde marzo de 1969 hasta agosto de 1971 en el Departamento de Biofísica y Genética de la Facultad de Medicina de la Universidad de Colorado, Boulder. ^{[ cita necesaria ]}

Su investigación se centra en la aplicación de diversos métodos informáticos y matemáticos para el descubrimiento de patrones sintácticos y semánticos en secuencias de ácidos nucleicos y aminoácidos. En los últimos años, esto se ha centrado en la evolución molecular de las familias de proteínas. como las hélices beta de repetición WD, la GTPasa asociada a la traducción y las proteínas ribosómicas. ^[7] Es conocido por la creación del algoritmo Smith-Waterman . ^[3]

Smith ha ocupado los siguientes nombramientos:

• 1965–1966: Instructor , Fuerza Aérea de EE. UU. Lowery, Denver, CO
• 1971–1984: Profesor , Departamento de Física, Universidad del Norte de Michigan, Marquette, MI
• 1985–1991: Director , Recursos de Investigación Informática de Biología Molecular, Instituto del Cáncer Dana-Farber, Facultad de Medicina de Harvard y Escuela de Salud Pública de Harvard
• 1991–2009: Director , Centro de Recursos de Ingeniería BioMolecular, Universidad de Boston
• 1999–: Coorganizador del Día del Descubrimiento de la Biotecnología del Instituto para el Avance Académico de la Juventud de 1999
• 2000–: Cofundador y Director de Información , Modular Genetics, Inc.
• 2000–: Entrenador de hockey juvenil ^{[ cita necesaria ]}

Publicaciones Seleccionadas

• M. Mariotti, TF Smith, PH Sudmant y G. Goldberger, “La pseudogenización de Lfg5 específico de testículo es anterior a la divergencia entre humanos y neandertales”, Journal of Human Genetics 59, 288–291 (2014)
• Hyman Hartman y Temple F. Smith "La evolución del ribosoma y el código genético", Life, 4(2), 227–249 (2014)
• Hartman, H y TF Smith, "GTPasas y el origen del ribosoma", Biology Direct, 5:36-39, (2010)
• Hartman, Hyman y Smith, Temple F. “La evolución del cilio y la célula eucariota” Cell Motility and the Cytoskeleton.66: 215-219. (2009)
• Hu, Lan, Smith, Temple F. y Goldberger, Gabriel. “LFG: una familia de genes reguladores de la apoptosis candidata” Apoptosis. 14: 1255-1265. (2009)
• Smith, Temple F., Lee, Jung C., Gutell, Robin R. y Hartman, Hyman. “El origen y evolución del ribosoma” Biology Direct 3: 16, 1–13 (2008)
• Smith, Temple F. “Capítulo 2: Diversidad de proteínas repetidas WD” La familia de proteínas Coronin, 20–30 (2008)
• Bhutkar, Arjun V., Gelbart, William M. y Smith, Temple F. (2007). Inferir filogenia de reordenamiento a escala del genoma y orden genético ancestral: un estudio de caso de Drosophila. Biología del genoma 8, R236
• Bhutkar, Arjun, Russo, Susan M., Smith, Temple F. y Gelbart, William M. “Análisis a escala genómica de genes reubicados posicionalmente” Genome Research 17: 1880-1887 (2007)
• Hartman, Hyman, Favaretto, Paola y Smith, Temple F. “Los orígenes arqueales del sistema traslacional eucariótico” Archaea 2: 1-9 (2006)
• Bienkowska, Jadwiga, Hartman, Hyman y Smith, Temple F. (2003). ¿Un método de búsqueda de homólogos de proteínas pequeñas, proteínas similares a la ubiquitina, en células procarióticas? Ingeniería de proteínas 16 (12), 897–904.
• Venkatesan, Kavitha, McManus, Heather R., Mello, Craig C., Smith, Temple F. y Hansen, Ulla. (2003). Conservación funcional entre miembros de una antigua familia de factores de transcripción duplicados, LSF/Grainyhead. Investigación de ácidos nucleicos 31(15), 4304–4316.
• Zhang YX1, Fox JG, Ho Y, Zhang L, Stills HF Jr, Smith TF. Comparación del gen de la proteína principal de la membrana externa (MOMP) de la neumonitis del ratón (MoPn) y de las cepas SFPD de hámster de Chlamydia trachomatis con otras cepas de Chlamydia. Mol Biol Evol. 10(6):1327–42.
• Figge J, Smith TF. Motivo de secuencia de división celular. Naturaleza 334 (6178), 109 (14 de julio de 1988) |pmid=3290690 |doi=10.1038/334109a0.

Premios y honores

Smith recibió el premio ISCB Senior Scientist Award ^[1] y fue elegido miembro de ISCB en 2009 por la Sociedad Internacional de Biología Computacional . ^[2]

En 2002, fue admitido en el Instituto Americano de Ingeniería Médica y Biológica (AIMBE) "por sus extraordinarias contribuciones en la definición y el avance del campo de la bioinformática, con énfasis en nuevos métodos de ingeniería para predecir la estructura y función de las proteínas". ^{[ cita necesaria ]}

Referencias

1. Maisel, M. (2007). "ISCB honra a Temple F. Smith y Eran Segal". PLOS Biología Computacional . 3 (6): e128. Código Bib : 2007PLSCB...3..128M. doi : 10.1371/journal.pcbi.0030128 . PMC  1904388 . PMID  17604447.
2. "Becarios ISCB". iscb.org . Sociedad Internacional de Biología Computacional . 2017. Archivado desde el original el 20 de marzo de 2017.
3. Smith, T.; Waterman, MS (1981). "Identificación de subsecuencias moleculares comunes". Revista de biología molecular . 147 (1): 195-197. CiteSeerX 10.1.1.63.2897 . doi :10.1016/0022-2836(81)90087-5. PMID  7265238. 
4. "Centro de Investigación de Ingeniería BioMolecular | Universidad de Boston". Bmerc-www.bu.edu . Consultado el 24 de marzo de 2017 .
5. "Templo Smith". Archivado desde el original el 7 de julio de 2007 . Consultado el 3 de mayo de 2007 .
6. Smith, Temple Ferris (1969). Las amplitudes del deuterón a partir de una teoría de la dispersión nuclear de partículas compuestas (tesis doctoral). Universidad de Colorado en Boulder. OCLC  50252533. ProQuest  302393082.
7. "Temple F. Smith, Ph.D.» Microbiología »BUMC". Archivado desde el original el 4 de abril de 2012 . Consultado el 28 de octubre de 2011 .