La proteína transmembrana 8A es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen TMEM8A (16p13.3.). Evolutivamente, los ortólogos de TMEM8A se encuentran en primates y mamíferos y en algunas especies más distantemente relacionadas. TMEM8A contiene cinco dominios transmembrana y un dominio similar al EGF, todos ellos altamente conservados en el espacio del ortólogo. Aunque no hay una función confirmada de TMEM8A, a través del análisis de la expresión y los datos experimentales, se predice que TMEM8A es una proteína de adhesión que desempeña un papel en el mantenimiento de las células T en su estado de reposo.
El gen humano TMEM8A se encuentra en el cromosoma 16 en la banda 16p13.3. [4]
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La longitud de este gen en el cromosoma 16 va desde el par de bases 420.773 hasta el 437.113, lo que hace que este gen tenga una longitud de 16.340 pares de bases. Este gen se encuentra en la hebra negativa del cromosoma. [6] No se conocen isoformas .
TMEM8A también se conoce como proteína transmembrana 8A, proteína transmembrana 6, proteína transmembrana de cinco tramos M83, TMEM6, TMEM8, proteína transmembrana 8 y M83. [7]
El gen codifica una proteína también llamada TMEM8A. Esta proteína tiene una longitud de 771 aminoácidos, pero se ha demostrado que tiene un péptido señal del aminoácido 1 al 34; la forma madura de la proteína tiene solo 737 aminoácidos de longitud. La forma precursora con el péptido señal intacto tiene un peso molecular de 84,780 kilodaltons y la forma madura con el péptido señal escindido tiene un peso molecular de 81,624 kilodaltons [9]. TMEM8A tiene un punto isoeléctrico de la forma madura de pI=7,3. [10]
TMEM8A es una proteína transmembrana con cinco dominios transmembrana, lo que la convierte en una de las tres únicas proteínas que se encuentran en el cuerpo humano con cinco dominios; los otros dos son CD47 y AC133. La proteína también contiene un dominio similar al EGF , que es una secuencia de aproximadamente treinta a cuarenta residuos de aminoácidos, que se encuentra en la secuencia del factor de crecimiento epidérmico (EGF), que se ha demostrado que está presente en una forma más o menos conservada en una gran cantidad de otras proteínas, principalmente animales. La importancia funcional de los dominios EGF en lo que parecen ser proteínas no relacionadas aún no está clara. Sin embargo, una característica común es que estas repeticiones se encuentran en el dominio extracelular de las proteínas unidas a la membrana o en proteínas que se sabe que se secretan. El dominio EGF incluye seis residuos de cisteína que se ha demostrado (en EGF) que están involucrados en enlaces disulfuro. La estructura principal es una lámina beta de dos cadenas seguida de un bucle a una lámina corta de dos cadenas C-terminal. Los subdominios entre las cisteínas conservadas varían en longitud. [11]
Se ha demostrado que la proteína sufre glicosilación postraduccionalmente en los aminoácidos 144, 407 y 431. [12] También hay tres enlaces disulfuro entre los aminoácidos 498 y 508, 502 y 521, y 523 y 532. Estos enlaces disulfuro son todos característicos de las proteínas con un dominio similar al EGF.
Se ha descubierto que TMEM8A se expresa de forma ubicua en todo el cuerpo humano; sin embargo, se ha demostrado que se regula a la baja durante la activación de las células T CD4+ y CD8+. [13]
Existen tres variantes de transcripción naturales de TMEM8A. Una se encuentra en el aminoácido 136, donde se sustituye una treonina por una alanina. Otra se encuentra en el aminoácido 310, donde se sustituye una isoleucina por una valina, y otra en el aminoácido 567, donde se sustituye una arginina por un triptófano. Ninguna de estas variantes da lugar a un cambio de expresión ni a mutaciones de pérdida o ganancia de función. [14]
Existen muchos sitios de unión de factores de transcripción previstos en el promotor TMEM8A. A continuación se muestra una tabla con las mejores posibilidades, que tienen altos valores de confianza, conservación evolutiva y/o múltiples sitios de unión posibles en el promotor.
Se ha demostrado que TMEM8A interactúa con las siguientes proteínas