Sir Khalifa II bin Harub Al-Busaidi GCB GCMG GBE (26 de agosto de 1879 - 9 de octubre de 1960) ( árabe : السيد خليفة بن حارب البوسعيدي ) fue el noveno sultán de Zanzíbar del 9 de diciembre de 1911 al 9 de octubre de 1960.
Su padre era Harub bin Thuwaini, hijo de Thuwaini bin Said, sultán de Mascate y Omán . En 1900 se casó con Sayyida Matuka bint Hamud Al-Busaid, hija del séptimo sultán de Zanzíbar y hermana del octavo sultán . También se casó con su segunda esposa, Sultana Nunu. Fue sucedido por su hijo mayor superviviente, Sayyid Sir Abdullah bin Khalifa . [ cita necesaria ]
Parte del museo del Palacio del Sultán de Zanzíbar está dedicado a Sir Khalifa.