Sir Thomas Morgan (fallecido el 5 de junio de 1565) fue un miembro del Parlamento inglés.
Era el hijo mayor de Sir William Morgan de Pencoed, Monmouthshire.
Fue pensionista de caballeros desde 1540 hasta 1544 y juez de paz de Monmouthshire desde 1543 hasta su muerte. Sirvió en las guerras francesas en 1544 y fue nombrado caballero en el sitio de Boulogne . Fue elegido diputado por Monmouthshire a su regreso en 1546 y fue nombrado alto sheriff de Monmouthshire durante 1547-1548 y 1558-1559.
Se casó con Cecily, hija de Sir George Herbert de Swansea, Glamorgan; tuvieron cinco hijos y una hija. Su hijo, Sir William, fue diputado por Monmouth Boroughs.