Sine2

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La nesprina-2 es una proteína que en los humanos está codificada por el gen SYNE2 . ^{[5] [6] [7]} El gen SYNE2 humano consta de 116 exones y codifica la nesprina-2, un miembro de la familia de repeticiones de espectrina ( nesprina ) de la envoltura nuclear (NE). Las nesprinas son proteínas modulares con un dominio de varilla de repetición de espectrina (SR) extendido central y un dominio transmembrana de homología Klarsicht/ANC-1/Syne (KASH) C-terminal, que actúa como un motivo de direccionamiento a NE. La nesprina-2 (Nesp2) se une a la F-actina citoplasmática , uniendo el núcleo al citoesqueleto y manteniendo la integridad estructural del núcleo.

El gen humano SYNE2 codifica una proteína de 6.885 aminoácidos (isoforma 1, Nesp2 gigante); el empalme alternativo del ARNm produce transcripciones que codifican una isoforma más grande y numerosas isoformas más pequeñas, algunas de las cuales son específicas de varios tejidos; los sitios alternativos de inicio y terminación dentro del ARNm también permiten la traducción de isoformas más pequeñas, muchas de las cuales poseen secuencias N- o C-terminales únicas codificadas por intrones retenidos. Dos mecanismos crean variantes de empalme de nesprina-2 con el dominio KASH eliminado (deltaKASH). En las variantes deltaKASH1, la eliminación de los exones 111-112 del casete da como resultado un cambio de marco que altera el dominio KASH pero conserva la región no traducida (UTR) 3' en el exón 116 utilizada para las isoformas que contienen el dominio KASH. Este mecanismo, que también ocurre en el ARNm de SYNE1 que codifica nesprina-1 ( enaptina ), genera isoformas de deltaKASH1 que terminan con una cola distintiva de 11 aminoácidos (GIAGHSATPPA reemplazando YPMLRYTNGPPPT en isoformas con KASH). La utilización de un codón de terminación alternativo en el exón 115, que es seguido por un UTR 3' distintivo, genera variantes de deltaKASH2. Este mecanismo trunca isoformas más grandes sin generar una secuencia C-terminal distintiva. La expresión de variantes de deltaKASH1 ocurre principalmente en el cerebro y el riñón, con cantidades más pequeñas en el corazón; las variantes de deltaKASH2 se detectan en el corazón y el bazo. ^[8]

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000054654 – Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000063450 – Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (julio de 1999). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. XIII. Las secuencias completas de 100 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro". DNA Res . 6 (1): 63–70. doi : 10.1093/dnares/6.1.63 . PMID  10231032.
6. Apel ED, Lewis RM, Grady RM, Sanes JR (noviembre de 2000). "Syne-1, una proteína relacionada con la distrofina y Klarsicht asociada con los núcleos sinápticos en la unión neuromuscular". J Biol Chem . 275 (41): 31986–95. doi : 10.1074/jbc.M004775200 . PMID  10878022.
7. "Gen Entrez: repetición de espectrina SYNE2 que contiene envoltura nuclear 2".
8. Rajgor D, Mellad JA, Autore F, Zhang Q, Shanahan CM (julio de 2012). "Varias variantes nuevas de nesprin-1 y nesprin-2 actúan como andamiajes intracelulares específicos de tejido versátiles". PLOS ONE . ​​7 (7): e40098. Bibcode :2012PLoSO...740098R. doi : 10.1371/journal.pone.0040098 . PMC 3388047 . PMID  22768332. 

Lectura adicional

• Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, et al. (2003). "Construcción de clones de ADNc listos para expresión para genes KIAA: curación manual de 330 clones de ADNc de KIAA". Res. ADN . 9 (3): 99-106. doi : 10.1093/dnares/9.3.99 . PMID  12168954.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanas: secuenciación y análisis de 500 nuevos ADNc humanos que codifican proteínas completas". Genome Res . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC  311072 . PMID  11230166.
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• Zhen YY, Libotte T, Munck M, et al. (2003). "NUANCE, una proteína gigante que conecta el núcleo y el citoesqueleto de actina". J. Cell Sci . 115 (Pt 15): 3207–22. doi :10.1242/jcs.115.15.3207. PMID  12118075.
• Zhang Q, Ragnauth C, Greener MJ, et al. (2003). "Las nesprinas son proteínas gigantes que se unen a la actina, ortólogas de la proteína muscular MSP-300 de Drosophila melanogaster". Genomics . 80 (5): 473–81. doi :10.1016/S0888-7543(02)96859-X. PMID  12408964.
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