El sexto gobierno de Jordi Pujol se formó el 30 de noviembre de 1999, tras su reelección como presidente de la Generalitat de Cataluña por el Parlamento de Cataluña el 16 de noviembre de 1999 y su investidura el 29 de noviembre de 1999, como resultado de que el Partido Socialista de Cataluña (PSC) y la oposición se quedaran a un escaño de la mayoría parlamentaria en las elecciones autonómicas catalanas de 1995 , lo que permitió que Convergencia y Unión (CiU) siguiera gobernando con el apoyo externo del Partido Popular (PP). Sucedió al quinto gobierno de Pujol y fue el Gobierno de Cataluña desde el 30 de noviembre de 1999 hasta el 22 de diciembre de 2003, un total de 1.483 días, o 4 años y 22 días.
El gabinete estaba formado por un gobierno integrado íntegramente por CiU, con miembros de Convergencia Democrática de Cataluña (CDC) y su partido hermano, la Unión Democrática de Cataluña (UDC). Fue destituido automáticamente el 17 de noviembre de 2003 como consecuencia de las elecciones regionales de 2003 , pero permaneció en funciones hasta que se instituyó el siguiente gobierno .
El Consejo Ejecutivo se estructuró en la oficina del presidente y 14/13 ministerios.