SEPT15

Protein-coding gene in the species Homo sapiens

La selenoproteína de 15 kDa es una proteína que en humanos está codificada por el gen SEP15 . ^[5] Se han encontrado para este gen dos variantes de transcripción empalmadas alternativamente que codifican distintas isoformas .

Función

Este gen codifica una selenoproteína , que contiene un residuo de selenocisteína (Sec) en su sitio activo. La selenocisteína está codificada por el codón UGA que normalmente señala la terminación de la traducción. La UTR 3' de los genes de selenoproteína tiene una estructura de tallo-bucle común , la secuencia de inserción sec ( SECIS ), que es necesaria para el reconocimiento de UGA como un codón Sec en lugar de como una señal de parada. Los estudios en ratones sugieren que esta selenoproteína puede tener función redox y puede estar involucrada en el control de calidad del plegamiento de proteínas . ^[5]

Significación clínica

Este gen está localizado en el cromosoma 1p31, un locus genético comúnmente mutado o eliminado en los cánceres humanos. ^[5]

Dominio proteico

La proteína que codifica este gen a menudo se denomina Sep15; sin embargo, en el caso de los ratones , se denomina SelM . Esta proteína es una selenoproteína que sólo se encuentra en eucariotas . Este dominio tiene un dominio similar a tiorredoxina y un motivo redox de sitio activo accesible a la superficie . ^[6] Esto sugiere que funcionan como tioldisulfuro isomerasas involucradas en la formación de enlaces disulfuro en el retículo endoplásmico . ^[6]

Función

Estudios recientes han demostrado que en ratones, cuando el gen SEP15 fue silenciado, los ratones posteriormente se volvieron deficientes en SEP15 y pudieron inhibir el desarrollo del cáncer colorrectal. ^[7]

Estructura

La estructura particular tiene un dominio central alfa/beta que en realidad está formado por tres hélices alfa y una lámina beta mixta de cuatro cadenas paralelas/antiparalelas . ^[6]

Referencias

1. GRCh38: Ensembl lanzamiento 89: ENSG00000183291 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl lanzamiento 89: ENSMUSG00000037072 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. "Gen Entrez: selenoproteína SEP15 de 15 kDa".
6. Ferguson AD, Labunskyy VM, Fomenko DE, Araç D, Chelliah Y, Amezcua CA, Rizo J, Gladyshev VN, Deisenhofer J (febrero de 2006). "Las estructuras de RMN de las selenoproteínas Sep15 y SelM revelan la actividad redox de una nueva familia similar a las tiorredoxinas". La Revista de Química Biológica . 281 (6): 3536–43. doi : 10.1074/jbc.M511386200 . PMID  16319061.
7. Tsuji PA, Naranjo-Suarez S, Carlson BA, Tobe R, Yoo MH, Davis CD (septiembre de 2011). "La deficiencia de selenoproteína de 15 kDa inhibe el crecimiento de células de cáncer de colon humano". Nutrientes . 3 (9): 805–17. doi : 10.3390/nu3090805 . PMC 3257736 . PMID  22254125. 

Otras lecturas

• Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de la tapa de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gen.​ 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (octubre de 1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5'". Gen.​ 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
• Gladyshev VN, Jeang KT, Wootton JC, Hatfield DL (abril de 1998). "Una nueva proteína humana que contiene selenio. Purificación, caracterización y secuencia de ADNc". La Revista de Química Biológica . 273 (15): 8910–5. doi : 10.1074/jbc.273.15.8910 . PMID  9535873.
• Kumaraswamy E, Malykh A, Korotkov KV, Kozyavkin S, Hu Y, Kwon SY, Moustafa ME, Carlson BA, Berry MJ, Lee BJ, Hatfield DL, Diamond AM, Gladyshev VN (noviembre de 2000). "Relaciones estructura-expresión del gen de la selenoproteína de 15 kDa. Posible papel de la proteína en la etiología del cáncer". La Revista de Química Biológica . 275 (45): 35540–7. doi : 10.1074/jbc.M004014200 . PMID  10945981.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (marzo de 2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanos: secuenciación y análisis de 500 nuevos ADNc humanos que codifican proteínas completas". Investigación del genoma . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC  311072 . PMID  11230166.
• Korotkov KV, Kumaraswamy E, Zhou Y, Hatfield DL, Gladyshev VN (mayo de 2001). "Asociación entre la selenoproteína de 15 kDa y UDP-glucosa: glicoproteína glucosiltransferasa en el retículo endoplásmico de células de mamíferos". La Revista de Química Biológica . 276 (18): 15330–6. doi : 10.1074/jbc.M009861200 . PMID  11278576.
• Kumaraswamy E, Korotkov KV, Diamond AM, Gladyshev VN, Hatfield DL (2002). "Análisis genético y funcional de la selenoproteína Sep15 de mamíferos". Sensores de proteínas y especies reactivas de oxígeno - Parte A: Selenoproteínas y tioredoxina . Métodos en enzimología. vol. 347, págs. 187–97. doi :10.1016/S0076-6879(02)47017-6. ISBN 978-0-12-182248-4. PMID  11898406.
• Wu HJ, Lin C, Zha YY, Yang JG, Zhang MC, Zhang XY, Liang X, Fu M, Wu M (febrero de 2003). "[Reacciones redox del 15 de septiembre y su relación con el desarrollo de tumores]". AI Zheng = Aizheng = Revista China sobre el Cáncer . 22 (2): 119–22. PMID  12600282.
• Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (mayo de 2003). "Exploración de proteomas y análisis del procesamiento de proteínas mediante identificación espectrométrica de masas de péptidos N-terminales ordenados". Biotecnología de la Naturaleza . 21 (5): 566–9. doi :10.1038/nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Apostolou S, Klein JO, Mitsuuchi Y, Shetler JN, Poulikakos PI, Jhanwar SC, Kruger WD, Testa JR (junio de 2004). "Inhibición del crecimiento e inducción de apoptosis en células de mesotelioma por selenio y dependencia del genotipo de selenoproteína SEP15". Oncogén . 23 (29): 5032–40. doi : 10.1038/sj.onc.1207683 . PMID  15107826.
• Wellenreuther R, Schupp I, Poustka A, Wiemann S (junio de 2004). "Amplificación SMART combinada con fraccionamiento por tamaño del ADNc para obtener clones grandes de longitud completa". Genómica BMC . 5 (1): 36. doi : 10.1186/1471-2164-5-36 . PMC  436056 . PMID  15198809.