La Segunda División chipriota 2005-06 fue la 51ª temporada de la liga chipriota de fútbol de segundo nivel . AEP Paphos ganó su primer título.
Catorce equipos participaron en la Segunda División chipriota 2005-06. Todos los equipos jugaron entre sí dos veces, una en casa y otra fuera. El equipo con más puntos al final de la temporada se coronó campeón. Los primeros tres equipos ascendieron a la Primera División chipriota 2006-07 y los últimos tres equipos descendieron a la Tercera chipriota 2006-07 .
Equipos ascendidos a la Primera División chipriota 2005-06
Equipos relegados de la Primera División chipriota 2004-05
Equipos ascendidos de la Tercera chipriota 2004-05
Equipos relegados a la Tercera Chipriota 2005-06