Intrón genético en algunos protistas.
El intrón del grupo III es una clase de intrones que se encuentran en genes de ARNm de cloroplastos en protistas euglénidos . Tienen un dVI convencional de tipo grupo II con adenosina abultada, un dI aerodinámico, sin dII-dV y un consenso de sitio de empalme relajado. [1] : fig. 2 El empalme se realiza con dos reacciones de transesterificación con una adenosina abultada con dVI como nucleófilo iniciador ; el intrón se corta como un lazo. [2] No se sabe mucho sobre cómo funcionan, [1] aunque se ha construido un sistema de transformación de cloroplastos aislado. [3]
Descubrimiento e identificación
En 1984, Montandon y Stutz informaron ejemplos de un nuevo tipo de intrones en el cloroplasto de Euglena . [4] En 1989, David A. Christopher y Richard B. Hallick encontraron algunos ejemplos más y propusieron el nombre "intrones del Grupo III" para identificar esta nueva clase con las siguientes características: [5]
- Los intrones del grupo III son mucho más cortos que otras clases de intrones autoempalmables, oscilando entre 95 y 110 nucleótidos entre los conocidos por Christopher y Hallick e identificados en los cloroplastos. Por otro lado, Christopher y Hallick afirmaron: "Por el contrario, el intrón más pequeño del grupo II del cloroplasto de Euglena ... tiene 277 nucleótidos". [5]
- Sus secuencias conservadas próximas a los sitios de empalme tienen similitudes con las de los intrones del grupo II, pero tienen menos posiciones conservadas.
- No se asignan a la estructura secundaria conservada de los intrones del grupo II. (De hecho, Christopher y Hallick no pudieron identificar ningún elemento de estructura secundaria conservado entre los intrones del grupo III).
- Suelen estar asociados con genes implicados en la traducción y la transcripción.
- Son muy ricos en A+T.
En 1994, el descubrimiento de un intrón del grupo III con una longitud de un orden de magnitud mayor indicó que la longitud por sí sola no es el determinante del empalme en los intrones del grupo III. [2]
El empalme de los intrones del grupo III se produce mediante la formación de ARN circular y de lazo . [2] Las similitudes entre el grupo III y los intrones nucleares incluyen secuencias límite 5' conservadas, formación de lazos, falta de estructura interna y capacidad de utilizar límites de empalme alternativos. [1]
Ver también
Referencias
- ^ abc Copertino DW, Hallick RB (diciembre de 1993). "Intrones de twintrones de grupo II y grupo III: relaciones potenciales con intrones de pre-ARNm nucleares". Tendencias Bioquímica. Ciencia . 18 (12): 467–71. doi :10.1016/0968-0004(93)90008-b. PMID 8108859.
- ^ abc Donald W. Copertino DW; Salón ET; Van Hook FW; Jenkins KP; Hallick RB (1994). "Un twintrón del grupo III que codifica un gen similar a la madurasa se corta a través de intermediarios de lazo". Ácidos nucleicos Res . 22 (6): 1029–36. doi :10.1093/nar/22.6.1029. PMC 307926 . PMID 7512259.
- ^ Doetsch, NA; Favreau, señor; Kuscuoglu, N; Thompson, MD; Hallick, RB (febrero de 2001). "Transformación de cloroplasto en Euglena gracilis: empalme de un twintrón del grupo III transcrito de un operón psbK transgénico". Genética actual . 39 (1): 49–60. doi :10.1007/s002940000174. PMID 11318107. S2CID 6413004.
- ^ Montandon PE, Stutz E (septiembre de 1983). "Secuencia de nucleótidos de una región del genoma del cloroplasto de Euglena gracilis que codifica el factor de elongación Tu; evidencia de un ARNm empalmado". Ácidos nucleicos Res . 11 (17): 5877–92. doi : 10.1093/nar/11.17.5877. PMC 326324 . PMID 6310519.
- ^ ab Christopher DA, Hallick RB (octubre de 1989). "Operón de la proteína ribosomal del cloroplasto de Euglena gracilis: un nuevo gen del cloroplasto para la proteína ribosomal L5 y descripción de una nueva categoría de intrón de orgánulo designada como grupo III". Ácidos nucleicos Res . 17 (19): 7591–608. doi : 10.1093/nar/17.19.7591. PMC 334869 . PMID 2477800.
enlaces externos
