La temporada de 1991 de los 49ers de San Francisco fue la temporada número 42 de la franquicia en la Liga Nacional de Fútbol Americano (NFL) y la número 46 en general. La franquicia no se clasificó para la postemporada por primera vez desde la temporada de 1982, acortada por la huelga . Joe Montana se perdería toda la temporada por una lesión en el codo, lo que allanó el camino para que Steve Young asumiera el cargo de mariscal de campo titular del equipo.
En la Semana 17, los 49ers se encontraron sin controlar su destino. Los Atlanta Falcons ya habían barrido a los 49ers en 2 partidos muy igualados en la temporada regular y, por lo tanto, tenían el desempate en el comodín. Los New Orleans Saints tenían un récord de 10-5 al comenzar la semana y derrotaron a los Phoenix Cardinals , ganando la división.
Después de la temporada de 1990 , los 49ers dejaron desprotegidos a los incondicionales del equipo Roger Craig y Ronnie Lott y les permitieron ir a Los Angeles Raiders a través de la agencia libre Plan B.
En 1991, los 49ers anunciaron un prototipo de nuevo logotipo y diseño de casco. En lugar del tradicional óvalo "SF", este nuevo logotipo presentaba unos "49ers" estilizados en blanco con sombras negras y rojas. Sin embargo, la reacción de los fans fue tan abrumadoramente negativa que la idea fue descartada seis días después. [1] El único cambio en el uniforme sería el cambio de calcetines rojos con tres franjas blancas a calcetines rojos lisos y lisos.
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Con Joe Montana fuera de temporada por una lesión en el codo, Steve Young se convirtió en el mariscal de campo titular. El primer partido de la temporada, una revancha del Campeonato de la NFC del año anterior contra los New York Giants , fue la primera derrota como visitante sufrida por los 49ers desde que perdieron en Phoenix en 1988 . La derrota puso fin a un récord de la NFL que aún se mantiene: 18 victorias consecutivas en juegos como visitante en la temporada regular que abarcan las temporadas 1988-1990. El primer mes de la temporada vio al equipo inconsistente alternando victorias en casa y derrotas como visitante. En la semana 10 contra los Atlanta Falcons, Young sufrió una lesión en la rodilla que le hizo perderse cinco partidos. Con Young fuera y con el récord de los 49ers de 4-5, Steve Bono llevó a los 49ers a cinco victorias en 6 juegos. Sin embargo, Young regresó para el juego final; una victoria 52-14 sobre los Chicago Bears. Aunque los 49ers terminaron la temporada regular con 10-6, se perdieron los playoffs por primera vez desde 1982 (perdiendo en un desempate ante los Atlanta Falcons debido a haber perdido ambos encuentros). Sin embargo, Young ganaría el primero de cuatro títulos de pase.