En biología molecular , SNORD64 (también conocido como HBII-13 ) es una molécula de ARN no codificante (ARNnc) que funciona en la biogénesis (modificación) de otros ARN nucleares pequeños (ARNsn). Este tipo de ARN modificador se encuentra en el nucléolo de la célula eucariota, que es un sitio importante de biogénesis de ARNsn. Se lo conoce como ARN nucleolar pequeño (ARNsno) y también se lo suele denominar ARN guía.
SNORD64 pertenece a la clase de snoRNA de caja C/D que contiene los motivos de secuencia conservados conocidos como caja C (UGAUGA) y caja D (CUGA). La mayoría de los miembros de la familia de caja C/D funcionan en la dirección de la metilación 2'-O- específica del sitio de los ARN sustrato. [1]
El snoRNA HBII-13 se expresa principalmente en los tejidos del cerebro, pero también se encuentra en los pulmones, los riñones y los músculos; [2] sin embargo, el HBII-13 no tiene un ARN diana identificado. [3]
El gen HBII-13 se encuentra en un intrón de 460 kb de la gran unidad de transcripción expresada por vía paterna ( SNURF-SNRNP -UBE3A AS) junto con varios otros snoRNA HBII-436, HBII-437, HBII-438A/B y los grupos de HBII-85, HBII-52. [4] Este gen huésped es una transcripción antisentido del gen UBE3A expresado por vía materna.
Referencias
- ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (octubre de 2002). "Los snoRNP de caja C/D purificados son capaces de reproducir la 2'-O-metilación específica del sitio del ARN diana in vitro". Biología molecular y celular . 22 (19): 6663–8. doi :10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041 . PMID 12215523.
- ^ Cavaillé J, Buiting K, Kiefmann M, Lalande M, Brannan CI, Horsthemke B, Bachellerie JP, Brosius J, Hüttenhofer A (diciembre de 2000). "Identificación de genes de ARN nucleolar pequeño específicos del cerebro e impresos que exhiben una organización genómica inusual". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 97 (26): 14311–6. doi : 10.1073/pnas.250426397 . PMC 18915 . PMID 11106375.
- ^ Lestrade L, Weber MJ (enero de 2006). "snoRNA-LBME-db, una base de datos completa de snoRNAs de caja C/D y H/ACA humanos". Nucleic Acids Research . 34 (número de la base de datos): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . doi :10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365 . PMID 16381836.
- ^ Runte M, Hüttenhofer A, Gross S, Kiefmann M, Horsthemke B, Buiting K (noviembre de 2001). "El transcrito IC-SNURF-SNRPN sirve como anfitrión para múltiples especies de ARN nucleolar pequeño y como ARN antisentido para UBE3A". Human Molecular Genetics . 10 (23): 2687–700. doi :10.1093/hmg/10.23.2687. PMID 11726556.
Enlaces externos
- Página de ARN nucleolar pequeño SNORD64 en Rfam
- Entrada para SNORD64 en snoRNABase
