stringtranslate.com

SMIM11

La proteína 11 de membrana integral pequeña es una proteína que en los humanos está codificada por el gen SMIM11 . [3] [4]

Gene

Lugar

SMIM11 está ubicado en la cadena positiva del cromosoma 21 y tiene 4 exones . [4]

Expresión de SMIM11A en muestras de tejido humano.

Expresión

La expresión de SMIM11 es mayor en el cerebro , la tiroides y el estómago , aunque también se expresa en muchos otros tejidos. [4]

ARNm

No se conocen variantes de transcripción o isoformas de SMIM11. [5]

Proteína

La proteína SMIM11 tiene 58 aminoácidos de longitud. El peso molecular teórico de esta proteína es de 6 kDa y el pI teórico es 9. [6] La proteína está localizada en el citoplasma y las mitocondrias, así como en puntos focales de adhesión entre las células. [7] [8]

Dominios, motivos y modificaciones postraduccionales

SMIM11 contiene un dominio transmembrana. [9] La proteína también tiene un motivo dileucina. Las modificaciones postraduccionales incluyen el sitio de ubiquitilación , así como dos sitios fosforilados , uno en treonina y otro en serina [10] [11]

Estructura Secundaria y Estructura Terciaria

La proteína está compuesta principalmente de hélices alfa. [12] El extremo N-terminal de SMIM11 sobresale de la matriz extracelular, mientras que el extremo C-terminal se encuentra dentro del citoplasma de la célula. [13]

Estructura terciaria de SMIM11

Estructura cuaternaria e interacciones entre proteínas.

Aún no se han identificado las interacciones proteicas determinadas experimentalmente para SMIM11. [14]

Traducción conceptual de SMIM11

Homología y evolución

parálogos

No existen paralelos ni dominios paralelos para SMIM11

Ortólogos

SMIM11 tiene una gran cantidad de ortólogos. Estos ortólogos van desde otros mamíferos hasta aves, reptiles, anfibios y peces óseos. [15]

Tabla ortóloga de SMIM11

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl lanzamiento 89: ENSG00000205670 - Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ "Referencia humana de PubMed:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  3. ^ "P58511 · SIM11_HUMAN". www.uniprot.org . UniProt . Consultado el 23 de diciembre de 2022 .
  4. ^ abc "Proteína 11 de membrana integral pequeña SMIM11 [Homo sapiens (humano)]". ncbi.nlm.nih.gov . Centro Nacional de Información Biotecnológica , Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . Consultado el 23 de diciembre de 2022 .
  5. ^ "Codificación de proteínas SMIM11A". genecards.org .
  6. ^ "Calcular la expansión de la herramienta pI/Mw". expasy.org .
  7. ^ "Servidor PSORT II". psort.hgc.jp .
  8. ^ "Inmunohistoquímica de SMIM11A: el atlas de la proteína humana". proteinatlas.org .
  9. ^ "Proteína de membrana integral pequeña 11A (SMIM11A) de Homo sapiens, ARNm". ncbi.nlm.nih.gov . NCBI (Centro Nacional de Información Biotecnológica).
  10. ^ "Informe iPTMnet para P58511 (SMIM11A)". investigación.bioinformática.udel.edu .
  11. ^ "Servidor NetPhos 3.1". cbs.dtu.dk.​
  12. ^ "Resultados de Phyre2". sbg.bio.ic.ac.uk.​
  13. ^ "Servidor TMHHM". cbs.dtu.dk.​
  14. ^ "CUERDA FAM165B". string-db.org .
  15. ^ "Explosión de proteína NCBI". blast.ncbi.nlm.nih.gov .