Herramienta de investigación de arquitectura modular simple

Simple Modular Architecture Research Tool ( SMART ) es una base de datos biológica que se utiliza para identificar y analizar dominios proteicos dentro de secuencias proteicas. ^[1]^[2] SMART utiliza modelos de Markov con perfiles ocultos creados a partir de múltiples alineaciones de secuencias para detectar dominios proteicos en secuencias proteicas. La versión más reciente de SMART contiene 1204 modelos de dominio. ^[3] Los datos de SMART se utilizaron para crear la colección de bases de datos de dominios conservados y también se distribuyen como parte de la base de datos InterPro . ^[4] La base de datos está alojada en el Laboratorio Europeo de Biología Molecular en Heidelberg.

Referencias

^ Schultz J, Milpetz F, Bork P, Ponting CP (mayo de 1998). "SMART, una herramienta de investigación de arquitectura modular simple: identificación de dominios de señalización" (PDF) . Proc. Natl. Sci. USA . 95 (11): 5857–64. Bibcode :1998PNAS...95.5857S. doi : 10.1073/pnas.95.11.5857 . PMC 34487 . PMID 9600884.
^ Letunic I, Doerks T, Bork P (enero de 2009). "SMART 6: actualizaciones recientes y nuevos desarrollos". Nucleic Acids Res . 37 (número de la base de datos): D229–32. doi :10.1093/nar/gkn808. PMC 2686533 . PMID 18978020.
^ Letunic, Ivica; Doerks, Tobias; Bork, Peer (enero de 2015). "SMART: actualizaciones recientes, nuevos desarrollos y estado en 2015". Nucleic Acids Research . 43 (número de la base de datos): D257–260. doi :10.1093/nar/gku949. ISSN 1362-4962. PMC 4384020 . PMID 25300481.
^ Mulder NJ, Apweiler R, Attwood TK, et al. (septiembre de 2002). "InterPro: un recurso de documentación integrado para familias de proteínas, dominios y sitios funcionales". Brief. Bioinformática . 3 (3): 225–35. doi : 10.1093/bib/3.3.225 . PMID 12230031.