El sitio de utilización de Rho , también conocido por el acrónimo rut , es una secuencia de ARN en bacterias que se encuentra aguas arriba de la región terminadora y que sirve como sitio de unión para la proteína conocida como factor rho . Esta secuencia es necesaria para la terminación dependiente de rho de la transcripción del ADN en bacterias. La característica común del sitio rut es una abundancia de citosina y escasez de residuos de guanina , aunque estas secuencias varían ampliamente en diferentes genes con poca homología. [1]
Se han desarrollado algunos algoritmos para predecir dichos sitios. [2] [3]
Referencias
- ^ Los genes de Lewin X . Lewin, Benjamin., Krebs, Jocelyn E., Kilpatrick, Stephen T., Goldstein, Elliott S., Lewin, Benjamin. (10.ª ed.). Sudbury, Mass.: Jones y Bartlett. 2011. ISBN 9780763766320.OCLC 456641931 .
{{cite book}}: Mantenimiento de CS1: otros ( enlace ) - ^ Di Salvo, Marco; Puccio, Simone; Peano, Clelia; Lacour, Stephan; Alifano, Pietro (7 de marzo de 2019). "RhoTermPredict: un algoritmo para predecir terminadores de transcripción dependientes de Rho basado en bases de datos de Escherichia coli, Bacillus subtilis y Salmonella enterica". BMC Bioinformatics . 20 (1): 117. doi : 10.1186/s12859-019-2704-x . PMC 6407284 . PMID 30845912.
- ^ Nadiras, Cédric; Eveno, Eric; Schwartz, Annie; Figueroa-Bossi, Nara; Boudvillain, Marc (19 de septiembre de 2018). "Un modelo de predicción multivariante para la terminación de la transcripción dependiente de Rho". Investigación de ácidos nucleicos . 46 (16): 8245–8260. doi : 10.1093/nar/gky563 . PMC 6144790 . PMID 29931073.
