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Redondovirus

Los redondovirus (miembros de Redondoviridae ) son una familia de virus de ADN asociados a humanos . [2] Su nombre deriva de la estructura circular inferida del genoma viral (“ redondo ” significa redondo en español ). Los redondovirus se han identificado en estudios basados ​​en secuencias de ADN de muestras de humanos, principalmente muestras de la cavidad oral y las vías respiratorias superiores. [3] [4] [5]

Mapa del genoma de Redondoviridae

Virología

Taxonomía

El Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) ha asignado a los redondovirus a una nueva familia: los Redondoviridae . [1] [5] [6]

Clasificación

La familia Redondoviridae se divide en dos especies, Brisavirus y Vientovirus . [1] [5] Los nombres derivan de las palabras brisa y viento en español , que denotan la asociación con las vías respiratorias humanas. Se han propuesto múltiples cepas sobre la base de la estructura del genoma viral. [ cita requerida ]

Los redondovirus son miembros del grupo de virus de ADN monocatenario que contienen rep circular (CRESS). [7]

Genoma

El genoma del redondovirus es circular y, por analogía con otros virus CRESS, probablemente monocatenario. Los genomas tienen un tamaño que varía entre 3,0 y 3,1 kilobases. El genoma codifica tres proteínas inferidas: [ cita requerida ]

Epidemiología

Distribución

Los genomas del Redondovirus se han encontrado principalmente en muestras humanas analizadas mediante secuenciación de ADN metagenómico . Se han encontrado principalmente en muestras orales y de las vías respiratorias. [4] [5] En algunas poblaciones humanas, las muestras orales pueden mostrar hasta un 80 % de positividad para el Redondovirus. [10]

El análisis de una variedad de tipos de muestras derivadas de humanos mostró una fuerte correlación positiva del ADN del redondovirus y el ADN de la ameba oral Entamoeba gingivalis . Los estudios de seguimiento mostraron que un cultivo xénico que contenía Entamoeba gingivalis y bacterias alimentadoras también fue positivo para el ADN y el ARN del redondovirus. El análisis mediante reticulación intracelular (Hi-C) mostró reticulación del ADN del redondovirus con el ADN de Entamoeba , lo que respalda a Entamoeba gingivalis como huésped. [11] [12]

Asociaciones de enfermedades

Se desconoce si los redondovirus causan enfermedades en humanos. Algunos virus CRESS son patógenos conocidos, como el circovirus porcino tipo 2 [13]

Se ha informado que los redondovirus están asociados con la periodontitis . En un estudio, los niveles disminuyeron con el éxito del tratamiento. [5] También se ha descubierto que la abundancia de genomas de redondovirus es alta en algunos pacientes de la unidad de cuidados intensivos y en pacientes con COVID-19 grave. [14] En la actualidad, la base de estas asociaciones con enfermedades no está clara. [1] [5]

Referencias

  1. ^ abcd "Informe ICTV Redondoviridae".
  2. ^ Abbas A, Taylor LJ, Collman RG, Bushman FD, ICTV Report Consortium (enero de 2021). "Perfil de taxonomía del virus ICTV: Redondoviridae". The Journal of General Virology . 102 (1). doi : 10.1099/jgv.0.001526 . PMC 8116785 . PMID  33258767. 
  3. ^ Noell K, Kolls JK (mayo de 2019). "Definición adicional del viroma humano mediante NGS: identificación de Redondoviridae". Cell Host & Microbe . 25 (5): 634–635. doi :10.1016/j.chom.2019.04.010. PMC 6849504 . PMID  31071291. 
  4. ^ ab Cui L, Wu B, Zhu X, Guo X, Ge Y, Zhao K, Qi X, Shi Z, Zhu F, Sun L, Zhou M (noviembre de 2017). "Identificación y caracterización genética de un nuevo virus de ADN monocatenario circular en una muestra del tracto respiratorio superior humano". Archivos de Virología . 162 (11): 3305–3312. doi :10.1007/s00705-017-3481-3. ISSN  0304-8608. PMID  28707271. S2CID  9239411.
  5. ^ abcdef Abbas AA, Taylor LJ, Dothard MI, Leiby JS, Fitzgerald AS, Khatib LA, Collman RG, Bushman FD (agosto de 2019). "Redondoviridae, una familia de virus de ADN circulares pequeños del tracto ororrespiratorio humano asociado con periodontitis y enfermedades críticas". Cell Host & Microbe . 26 (2): 719–729.e4. doi :10.1016/j.chom.2019.07.015. PMC 6510254 . PMID  31071295. 
  6. ^ Abbas AA, Taylor LJ, Collman RG, Bushman FD (14 de octubre de 2019). "Crear una nueva familia (Redondoviridae) para virus de ADN circulares que codifican Rep". Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . Consultado el 25 de febrero de 2020 .[ enlace muerto ]
  7. ^ Zhao L, Rosario K, Breitbart M, Duffy S (2019), "Virus de ADN monocatenario con codificación de repetición circular eucariota (ADN CRESS): virus ubicuos con genomas pequeños y una gama diversa de hospedadores", Advances in Virus Research , 103 , Elsevier: 71–133, doi :10.1016/bs.aivir.2018.10.001, ISBN 978-0-12-817722-8, PMID  30635078, S2CID  58636379
  8. ^ abc Walker PJ. "2019.012DAv1.Cressdnaviricota" (XLSX) . Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . Consultado el 25 de febrero de 2020. Cressdnaviricota Arfiviricetes Recrevirales Redondoviridae [ enlace muerto ]
  9. ^ Krupovic M, Varsani A, Kuhn J, Kazlauskas D, Breitbart M, Delwart E, Rosario K, Yutin N, Wolf YI, Harrach B, Zerbini FM, Dolja VV, Koonin EV (2019). "Crear 1 nuevo filo (Cressdnaviricota) que incluya 2 clases y 6 órdenes para la clasificación de los virus CRESS-DNA". Propuesta de taxonomía ICTV 2019.012DAv1.Cressdnaviricota . Archivado desde el original el 12 de febrero de 2020.{{cite web}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  10. ^ Taylor LJ, Dothard MI, Rubel MA, Allen AA, Hwang Y, Roche AM, Graham-Wooten J, Fitzgerald AS, Khatib LA, Ranciaro A, Thompson SR, Beggs WR, Campbell MC, Mokone GG, Mpoloka SW, Fokunang C , Njamnshi AK, Mbunwe E, Woldemeskel D, Belay G, Nyambo T, Tishkoff SA, Collman RG, Bushman FD (octubre de 2021). "Diversidad y evolución de los redondovirus a escalas global, individual y molecular". J Virol . 95 (21): e0081721. doi :10.1128/JVI.00817-21. PMC 8513488 . PMID  34406857. 
  11. ^ Keeler E, Merenstein C, Reddy S, Taylor L, Cobian-Guemes A, Zankharia U, Collman R, Bushman F (1 de diciembre de 2022). "Los redondovirus generalizados asociados a humanos infectan al protozoo comensal Entamoeba gingivalis". Cell Host and Microbe . 31 (1): 58–68.e5. doi :10.1016/j.chom.2022.11.002. PMC 9969835 . PMID  36459997. S2CID  254179614. 
  12. ^ Kinsella C, Deijs M, Becker C, Broekhuizen P, van Gool T, Bart A, Schaefer A, van der Hoek L (16 de septiembre de 2022). "Predicción del hospedador para los cressdnavirus gastrointestinales asociados a enfermedades". Virus Evol . 8 (2): veac087. doi :10.1093/ve/veac087. PMC 9615429 . PMID  36325032. 
  13. ^ Meng XJ (enero de 2013). "Circovirus porcino tipo 2 (PCV2): patogénesis e interacción con el sistema inmunitario". Revisión anual de biociencias animales . 1 (1): 43–64. doi :10.1146/annurev-animal-031412-103720. ISSN  2165-8102. PMID  25387012.
  14. ^ Merenstein C, Liang G, Whiteside SA, Cobián-Güemes AG, Merlino MS, Taylor LJ, Glascock A, Bittinger K, Tanes C, Graham-Wooten J, Khatib LA, Fitzgerald AS, Reddy S, Baxter AE, Giles JR, Oldridge DA, Meyer NJ, Wherry EJ, McGinniss JE, Bushman FD, Collman RG (agosto de 2021). "Firmas de la gravedad de la COVID-19 y la respuesta inmunitaria en el microbioma del tracto respiratorio". mBio . 12 (4): e0177721. doi :10.1128/mBio.01777-21. PMC 8406335 . PMID  34399607. 

Enlaces externos

Datos relacionados con Redondoviridae en Wikispecies