Pseudomonas citronellolis es una bacteria bacilo Gram-negativa quese utiliza para estudiar los mecanismos de la piruvato carboxilasa . [1] Fue aislada por primera vez del suelo forestal , bajo pinos , en el norte de Virginia , Estados Unidos . [2]
Pseudomonas citronellolis es una bacteria bacilo gramnegativa . Fue aislada por primera vez del suelo forestal , bajo los pinos , en el norte de Virginia , Estados Unidos . [2] Tiene un flagelo polar que le permite ser móvil.
En agar, P. citronellolis forma colonias blancas redondas que producen pigmentos verdes fluorescentes. También produce una biopelícula y es resistente a la mayoría de los antibióticos . La bacteria tiene una relación biótica con su planta huésped (ya sea con pinos o albahaca). Produce un tipo de hormona que induce la elongación y división de las células vegetales, lo que conduce a un aumento de los nutrientes locales disponibles. [3]
El estudio de P. citronellolis es importante porque podría utilizarse como modelo para investigar el metabolismo y la actividad enzimática de la glucosa. También tiene potencial para su uso en la biodegradación del polietileno. [4]
El tamaño del genoma es de 6.951.444 pb y el tamaño de la codificación del ADN es de 6.028.113 pb. El contenido medio de GC es del 67,11 % y 4.665.300 pb. De los 6169 genes predichos, 6071 (98,41 %) eran CDS de proteínas, de los cuales 4762 genes tenían una predicción de función. Se predijeron un total de 96 genes de ARN, incluidos 15 ARNr. [3]
El aislamiento del ADN de Pseudomonas citronellolis para la secuenciación del gen 16sR de una plantilla reveló 25 μl de ADN genómico diluido. Se utilizaron BOXAIR, análisis de PCR basado en secuencia palindrómica extragénica repetitiva (REP-PCR) y consenso intergénico repetitivo enterobacteriano (ERIC) como cebadores para amplificar el ADN. La PCR para las 29 cepas de P. citronellolis produjo de 8 a 12 bandas amplificadas. Estas eran muy distinguibles con tamaños que oscilaban entre 9.000 pb y 100 pb. La REP-PCR produce los patrones de bandas amplificadas más complejos, que reflejaban la diversidad entre las cepas de P. citronellolis aisladas de diferentes muestras de suelo contaminado con lodos oleosos. Los patrones de ribotipo de las cepas de P. citronellolis mostraron múltiples amplicones que indicaban claramente el polimorfismo de la región espaciadora del ARNr. Este experimento sobre el genoma no contenía ningún plásmido y no proporcionó ninguna evidencia de su existencia. [5]
Basándose en el análisis del ARNr 16S , P. citronellolis se ha incluido en el grupo P. aeruginosa . [6] También se ha descubierto que P. citronellolis es capaz de biosíntesis de polihidroxicanoatos a partir de "ácidos mono y dicarboxílicos lineales", un tipo de poliéster sintetizado por bacterias . [7]
El genoma P3B5 de P. citronellolis contiene genes que codifican para seis lactamasas predichas que resisten a los antibióticos lactámicos. Además, el genoma contiene genes que codifican para bombas de eflujo que proporcionan resistencia a otros antibióticos, como la trimetoprima . El genoma P3B5 codifica genes que deberían permitirle degradar alcanos. En combinación con su resiliencia al estrés y su estilo de vida dependiente de las plantas, hace de este organismo un candidato intrigante para los enfoques de remediación de las plantas. Se observó resistencia a varios AB y se detectaron varios genes ABR, pero no se pudo encontrar evidencia del potencial de movilización de genes ABR. [4]