grid.org era un sitio web y una comunidad en línea establecida en 2001 para usuarios de software de computación en cluster y grid . Durante seis años operó varios proyectos informáticos voluntarios diferentes que permitieron a los miembros donar sus bicicletas de repuesto a causas valiosas. En 2007, se convirtió en una comunidad de software de computación grid y clusters de código abierto . Aproximadamente después de 2010, se redirigió a otros sitios.
Desde su creación en abril de 2001 hasta el 27 de abril de 2007, [1] grid.org fue el sitio web y la organización que ejecutó proyectos de computación distribuida como el Proyecto de Investigación del Cáncer de United Devices , dirigido por Jikku Venkat, Ph.D y patrocinado filantrópicamente por United Devices (UD) y sus miembros participaron en informática voluntaria ejecutando el software UD Agent (versión 3.0).
El Proyecto de Investigación del Cáncer de United Devices, que comenzó en 2001, buscaba posibles fármacos para el tratamiento del cáncer utilizando informática distribuida . [2] Había alrededor de 150.000 usuarios en los Estados Unidos y 170.000 en Europa, junto con cientos de miles más en otras partes del mundo.
El proyecto fue una alianza de varias empresas y organizaciones: [3]
United Devices lanzó el protector de pantalla para la investigación del cáncer bajo el principio de utilizar potencia informática adicional. El programa, que podía ejecutarse de forma continua, utilizaba un "detección virtual" para encontrar posibles interacciones entre las moléculas y las proteínas diana, es decir, un fármaco. Estas moléculas ( ligandos ) se envían al agente UD de la computadora host. Cuando estas moléculas se acoplan con éxito a una proteína objetivo, esta interacción se califica para una mayor investigación.
La investigación constó de dos fases:
El Proyecto de Plegado del Proteoma Humano ("HPF") patrocinado por IBM , fase 1, se anunció el 16 de noviembre de 2004 y se completó el 3 de julio de 2006. El proyecto operó simultáneamente tanto en grid.org como en World Community Grid de IBM . [7]
Utilizó el software "Rosetta" para predecir la estructura de las proteínas humanas con el fin de ayudar a predecir la función de las proteínas. Esta información algún día podrá usarse para ayudar a curar una variedad de enfermedades y defectos genéticos.
Según un anuncio en los foros de grid.org, [8] después de que se completó el proyecto HPF1, se dejó que continuara ejecutándose en grid.org hasta el 9 de agosto de 2006. [9] Durante ese tiempo, los miembros cuyas computadoras estaban configuradas para ejecutar este proyecto obtuvo nuevos trabajos y gastó recursos informáticos para calcular un resultado, pero el resultado se devolvió a grid.org solo para obtener puntos; no se utilizó para investigación científica.
El estado del Proyecto de Plegado del Proteoma Humano provocó cierta discusión en los foros de grid.org. La mayoría de los miembros querían ver toda la potencia informática disponible dirigida al proyecto contra el cáncer aún activo, [9] pero el representante de la UD, Robby Brewer, afirmó que "a algunos [usuarios] les gusta el protector de pantalla". [8] [10] Como se señaló anteriormente, al final se detuvo el trabajo redundante de HPF1 en grid.org. [9]
Smallpox Research Grid fue parte de la iniciativa "Patriot Grid" de United Devices para luchar contra el terrorismo biológico. Este proyecto ayudó a analizar posibles fármacos candidatos para una terapia médica en la lucha contra el virus de la viruela. Hizo uso del software "LigandFit" (que ya había sido utilizado en la fase 2 del proyecto de investigación del cáncer), pero con un conjunto especializado de moléculas diana dirigidas al virus de la viruela . [11]
Los socios del proyecto incluyeron la Universidad de Oxford , la Universidad de Western Ontario , el Memorial Sloan-Kettering Cancer Center , la Universidad de Essex , Evotec OAI, Accelrys e IBM . [12]
El World Community Grid comenzó en gran medida gracias al éxito de este proyecto. [ cita necesaria ]
El Proyecto de Investigación sobre Ántrax fue parte de la iniciativa "Patriot Grid" de United Devices para luchar contra el terrorismo biológico. Hizo uso del software "LigandFit" (que ya había sido utilizado en la fase 2 del proyecto de investigación del cáncer), pero con un conjunto especializado de moléculas objetivo que apuntaban a las etapas avanzadas de la infección bacteriana por ántrax .
El proyecto estuvo en funcionamiento desde el 22 de enero de 2002 hasta el 14 de febrero de 2002 y finalizó después de que un total de 3,57 mil millones de moléculas hubieran terminado de ser analizadas. Los resultados del proyecto de investigación se transmitieron a los biólogos para finalizar la selección de las simulaciones computacionales. [13]
Entre los socios del proyecto se encontraba la Universidad de Oxford .
El proyecto de investigación genética HMMER utilizó el modelo oculto de Markov para buscar patrones en secuencias genéticas de ADN. [14]
El proyecto Web Performance Testing se operó como una oportunidad comercial con proveedores de alojamiento web seleccionados para ayudarlos a probar la escalabilidad de sus infraestructuras de servidores en períodos de alta demanda. [15]
En noviembre de 2007, Univa reposicionó grid.org como una comunidad para permitir a los usuarios interactuar y discutir temas relacionados con clusters y grids de código abierto. [16] Permitió a los usuarios descargar, obtener soporte, contribuir e informar problemas sobre los productos basados en Globus Toolkit de código abierto ofrecidos por Univa. En 2008 se reportaron más de 100.000 visitantes únicos. [17] A mediados de 2010 redirigió a Unicluster.org (un producto de Univa) y en 2012 redirigió al sitio principal de Univa.