La proteína inhibidora (IP) está situada en la matriz mitocondrial y protege a la célula contra la rápida hidrólisis del ATP durante la isquemia momentánea . [1] En ausencia de oxígeno, el pH de la matriz desciende. Esto hace que IP se protone y cambie su conformación a una que pueda unirse a la sintetasa F1Fo y la detenga, evitando así que se mueva hacia atrás e hidrolice el ATP en lugar de producirlo. Cuando finalmente se incorpora oxígeno al sistema, el pH aumenta y el IP se desprotona. IP se disocia de la F1Fo sintetasa y le permite reanudar su síntesis de ATP.