Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens
La proteína de unión a Z-ADN 1 , también conocida como activador dependiente de ADN de factores reguladores de IFN ( DAI ) y DLM-1 , es una proteína que en los humanos está codificada por el gen ZBP1 . [5] [6]
ZBP1 es también una abreviatura de proteína 1 de unión a β-actina de pollo o rata , un homólogo de la proteína 1 de unión a ARNm del factor de crecimiento similar a la insulina 2 ( IMP-1 ) humana y CRD-BP murina , las proteínas involucradas en el transporte de ARNm ( proteínas de unión a ARN, RBP ).
Historia
La ZBP1 se identificó por primera vez como una proteína de unión a Z-NA inducible por interferón, [7] pero sus funciones específicas no se aclararon durante muchos años. Inicialmente se pensó que era un sensor de ADN citosólico. Sin embargo, la generación de ratones deficientes en Zbp1 reveló que estos ratones respondían normalmente a las infecciones por ADN y virus de ADN, produciendo niveles normales de interferón. [8]
Se obtuvieron más conocimientos con el descubrimiento de los dominios de interacción homotípica de proteínas que interactúan con el receptor (RHIM) de ZBP1, que median las interacciones con otras proteínas. Los experimentos mostraron que ZBP1 interactúa con RIPK1 y RIPK3 a través de estos dominios RHIM. [9] Esta interacción insinuó la participación de ZBP1 en la muerte celular, especialmente dado el papel de las proteínas RIPK en las vías de muerte celular.
El papel de ZBP1 como sensor inmunológico innato se hizo más evidente con el descubrimiento de que regula la activación del inflamasoma NLRP3 y la muerte celular inflamatoria, PANoptosis , durante la infección por el virus de la influenza A. Los ratones deficientes en ZBP1 mostraron una activación deteriorada de los componentes del inflamasoma, como la caspasa-1, y niveles reducidos de IL-1β e IL-18, lo que destaca su papel crítico en la defensa antiviral. [10]
Estructura
La ZBP1 tiene varios dominios clave que contribuyen a su función. En el extremo N, tiene dominios de unión al ácido nucleico Z (Z-NA), conocidos como Zα1 y Zα2. Ambos dominios Zα tienen una estructura de hélice-giro-hélice alada que les permite unirse al ARN/ADN Z. [11] La región intermedia de la ZBP1 contiene dos dominios de motivo de interacción homotípico de proteína que interactúa con el receptor (RHIM), RHIM1 y RHIM2, que facilitan las interacciones con otras proteínas que contienen el dominio RHIM. [9] [12] [13] [14] La región C-terminal de la ZBP1 contiene un dominio de señal (SD), que es crucial para desencadenar una respuesta de interferón. [15] [16] [17] [18] [19]
Función y papel en la enfermedad
Se descubrió que ZBP1 es un sensor inmunológico innato del virus de la influenza A que forma el ZBP1-PANoptosoma para activar el inflamasoma NLRP3 e impulsar la muerte celular, PANoptosis . La PANoptosis es una importante vía inmunitaria innata, inflamatoria y lítica de muerte celular iniciada por sensores inmunológicos innatos e impulsada por caspasas y proteínas quinasas que interactúan con el receptor (RIPK) a través de los PANoptosomas. [20] Los PANoptosomas son complejos multiproteicos ensamblados por receptores de reconocimiento de patrones (PRR) codificados por la línea germinal (sensores inmunológicos innatos) en respuesta a patógenos, incluidas infecciones bacterianas, virales y fúngicas, así como patrones moleculares asociados a patógenos , patrones moleculares asociados a daños , citocinas y cambios homeostáticos durante infecciones, afecciones inflamatorias y cáncer . [21] [22] [23] [24] Tras los descubrimientos con IAV, también se descubrió que el ZBP1-PANoptosoma desempeña un papel en la inflamación patógena en respuesta a la terapia con IFN durante la infección por coronavirus. [25]
Por el contrario, el ZBP1-PANoptosoma puede tener un beneficio terapéutico en modelos tumorales murinos, donde el tratamiento con IFN e inhibidores de la exportación nuclear modula la vía ZBP1-ADAR1 e impulsa la formación del ZBP1-PANoptosoma para hacer retroceder los tumores. Investigaciones recientes han identificado a la curaxina (CBL0137), un inhibidor de moléculas pequeñas, como capaz de inducir eficazmente la muerte celular mediada por ZBP1 en fibroblastos asociados al cáncer y revertir eficazmente la resistencia al bloqueo de puntos de control inmunitario (ICB) en modelos murinos de melanoma. [26]
ZBP1 también es un componente clave del PANoptosoma ausente en el melanoma 2 (AIM2), que incluye el inflamasoma AIM2, y se ensambla en respuesta a las infecciones por Francisella novicida y el virus del herpes simple 1 (HSV1). [27] ZBP1 también se ha implicado ampliamente en otras infecciones virales, incluidos los coronavirus , el citomegalovirus (CMV), [28] la vaccinia (VACV), [29] el virus de la varicela-zóster , [30] el virus del Zika (ZIKV), [31] y otros. Además, ZBP1 también induce PANoptosis durante las infecciones por Candida albicans y Aspergillus fumigatus . [32]
Unión de Z-NA
Se propone que ZBP1 sea una proteína de unión a Z-ADN . La formación de Z-ADN es un proceso dinámico, controlado en gran medida por la cantidad de superenrollamiento . [6] ZBP1 reconoce el ADN en el citoplasma como un mecanismo antiviral. Los ciclos de vida virales a menudo incluyen pasos en los que el ADN se expone en el citoplasma. El ADN normalmente está contenido en el núcleo de una célula y, por lo tanto, las células usan proteínas como ZBP1 como indicador de una infección viral. Una vez que ZBP1 se activa, aumenta la producción de citocinas antivirales como el interferón beta . [33] DLM1 luego se une al ADN viral citosólico utilizando dos dominios de unión a Z-ADN (Zα y Zβ) en su extremo N junto con un dominio de unión a ADN (D3). [34]
Se ha cuestionado el papel de ZBP1 en la detección del ADN. Se ha descubierto que detecta la infección por el virus de la gripe A (IAV) e induce la muerte celular. Dado que el ADN no se sintetiza en ninguna etapa del ciclo de vida del IAV, es poco probable que la detección del ADN desempeñe un papel en este contexto. [35] [36] Sin embargo, una investigación reciente ha descubierto que ZBP1 es capaz de detectar los ARN en forma Z producidos durante la infección por IAV, acumulándose en una forma de muerte celular inflamatoria independiente de la caspasa llamada necroptosis. [37]
Un estudio de seguimiento identificó que ZBP1 detecta el complejo de ribonucleoproteína IAV para inducir la muerte celular. [36] Un estudio más reciente ha identificado al factor de transcripción IRF1 como el regulador ascendente de la expresión de ZBP1. [38]
Referencias
- ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000124256 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000027514 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Rothenburg S, Schwartz T, Koch-Nolte F, Haag F (febrero de 2002). "Regulación compleja del gen humano para la proteína de unión a ADN-Z DLM-1". Nucleic Acids Research . 30 (4): 993–1000. doi :10.1093/nar/30.4.993. PMC 100341 . PMID 11842111.
- ^ ab "Entrez Gene: proteína de unión al ADN ZBP1 Z 1".
- ^ Fu Y, Comella N, Tognazzi K, Brown LF, Dvorak HF, Kocher O (noviembre de 1999). "Clonación de DLM-1, un gen novedoso que se regula positivamente en macrófagos activados, mediante visualización diferencial de ARN". Gene . 240 (1): 157–163. doi :10.1016/s0378-1119(99)00419-9. PMID 10564822.
- ^ Ishii KJ, Kawagoe T, Koyama S, Matsui K, Kumar H, Kawai T, et al. (febrero de 2008). "TANK-binding kinase-1 delinea las respuestas inmunitarias innatas y adaptativas a las vacunas de ADN". Nature . 451 (7179): 725–729. Bibcode :2008Natur.451..725I. doi :10.1038/nature06537. PMID 18256672.
- ^ ab Kaiser WJ, Upton JW, Mocarski ES (noviembre de 2008). "Control dependiente del motivo de interacción homotípica de la proteína que interactúa con el receptor de la activación de NF-kappa B a través del activador dependiente del ADN de factores reguladores de IFN". Journal of Immunology . 181 (9): 6427–6434. doi :10.4049/jimmunol.181.9.6427. PMC 3104927 . PMID 18941233.
- ^ Kuriakose T, Man SM, Malireddi RK, Karki R, Kesavardhana S, Place DE, et al. (Agosto de 2016). "ZBP1/DAI es un sensor innato del virus de la influenza que desencadena el inflamasoma NLRP3 y las vías de muerte celular programada". Inmunología científica . 1 (2). doi : 10.1126/sciimmunol.aag2045. PMC 5131924 . PMID 27917412.
- ^ Maelfait J, Rehwinkel J (agosto de 2023). "El sensor de ácido nucleico Z ZBP1 en la salud y la enfermedad". The Journal of Experimental Medicine . 220 (8): e20221156. doi :10.1084/jem.20221156. PMC 10347765 . PMID 37450010.
- ^ Hao Y, Yang B, Yang J, Shi X, Yang X, Zhang D, et al. (septiembre de 2022). "ZBP1: un potente sensor inmunológico innato y una espada de doble filo en la inmunidad del huésped". Revista internacional de ciencias moleculares . 23 (18): 10224. doi : 10.3390/ijms231810224 . PMC 9499459 . PMID 36142136.
- ^ Rebsamen M, Heinz LX, Meylan E, Michallet MC, Schroder K, Hofmann K, et al. (agosto de 2009). "DAI/ZBP1 recluta a RIP1 y RIP3 a través de motivos de interacción homotípicos de RIP para activar NF-kappaB". EMBO Reports . 10 (8): 916–922. doi :10.1038/embor.2009.109. PMC 2726668 . PMID 19590578.
- ^ Muendlein HI, Connolly WM, Magri Z, Smirnova I, Ilyukha V, Gautam A, et al. (enero de 2021). "ZBP1 promueve la muerte celular inducida por LPS y la liberación de IL-1β a través de interacciones mediadas por RHIM con RIPK1". Nature Communications . 12 (1): 86. Bibcode :2021NatCo..12...86M. doi :10.1038/s41467-020-20357-z. PMC 7782486 . PMID 33397971.
- ^ Wang Z, Choi MK, Ban T, Yanai H, Negishi H, Lu Y, et al. (abril de 2008). "Regulación de las respuestas inmunitarias innatas por DAI (DLM-1/ZBP1) y otras moléculas sensoras de ADN". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 105 (14): 5477–5482. Bibcode :2008PNAS..105.5477W. doi : 10.1073/pnas.0801295105 . PMC 2291118 . PMID 18375758.
- ^ Szczesny B, Marcatti M, Ahmad A, Montalbano M, Brunyánszki A, Bibli SI, et al. (Enero de 2018). "El daño del ADN mitocondrial y la posterior activación de la proteína 1 de unión al ADN Z vincula el estrés oxidativo con la inflamación en las células epiteliales". Informes científicos . 8 (1): 914. Código bibliográfico : 2018NatSR...8..914S. doi :10.1038/s41598-018-19216-1. PMC 5772643 . PMID 29343810.
- ^ Rebsamen M, Heinz LX, Meylan E, Michallet MC, Schroder K, Hofmann K, et al. (agosto de 2009). "DAI/ZBP1 recluta a RIP1 y RIP3 a través de motivos de interacción homotípicos de RIP para activar NF-kappaB". EMBO Reports . 10 (8): 916–922. doi :10.1038/embor.2009.109. PMC 2726668 . PMID 19590578.
- ^ Schwartz T, Behlke J, Lowenhaupt K, Heinemann U, Rich A (septiembre de 2001). "La estructura del complejo DLM-1-Z-DNA revela una familia conservada de proteínas de unión a Z-DNA". Nature Structural Biology . 8 (9) (publicado el 1 de septiembre de 2001): 761–765. doi :10.1038/nsb0901-761. PMID 11524677.
- ^ Rothenburg S, Schwartz T, Koch-Nolte F, Haag F (febrero de 2002). "Regulación compleja del gen humano para la proteína de unión a ADN-Z DLM-1". Nucleic Acids Research . 30 (4): 993–1000. doi :10.1093/nar/30.4.993. PMC 100341 . PMID 11842111.
- ^ Pandeya A, Kanneganti TD (enero de 2024). "Potencial terapéutico de la PANoptosis: sensores innatos, inflamasomas y RIPK en PANoptosomas". Tendencias en medicina molecular . 30 (1): 74–88. doi :10.1016/j.molmed.2023.10.001. PMC 10842719. PMID 37977994.
- ^ Zheng M, Kanneganti TD (septiembre de 2020). "La regulación del inflamasoma ZBP1-NLRP3 y sus implicaciones en la piroptosis, la apoptosis y la necroptosis (PANoptosis)". Revisiones inmunológicas . 297 (1): 26–38. doi :10.1111/imr.12909. PMC 7811275 . PMID 32729116.
- ^ Karki R, Kanneganti TD (marzo de 2023). "ADAR1 y ZBP1 en la inmunidad innata, la muerte celular y la enfermedad". Tendencias en inmunología . 44 (3): 201–216. doi :10.1016/j.it.2023.01.001. PMC 9974732 . PMID 36710220.
- ^ Karki R, Kanneganti TD (agosto de 2023). "Señalización del PANoptosoma e implicaciones terapéuticas en la infección: papel central de ZBP1 para activar el inflamasoma y la PANoptosis". Current Opinion in Immunology . 83 : 102348. doi :10.1016/j.coi.2023.102348. PMC 10524556 . PMID 37267644.
- ^ Song Q, Qi Z, Wang K, Wang N (abril de 2024). "Sensor de ácido nucleico Z ZBP1 en inflamación estéril". Inmunología clínica . 261 . Orlando, Fla.: 109938. doi :10.1016/j.clim.2024.109938. PMID 38346464.
- ^ Karki R, Lee S, Mall R, Pandian N, Wang Y, Sharma BR, et al. (agosto de 2022). "La muerte celular inflamatoria dependiente de ZBP1, la PANoptosis y la tormenta de citocinas alteran la eficacia terapéutica del IFN durante la infección por coronavirus". Science Immunology . 7 (74): eabo6294. doi :10.1126/sciimmunol.abo6294. PMC 9161373 . PMID 35587515.
- ^ Zhang T, Yin C, Fedorov A, Qiao L, Bao H, Beknazarov N, et al. (junio de 2022). "ADAR1 enmascara la promesa inmunoterapéutica contra el cáncer de la necroptosis impulsada por ZBP1". Nature . 606 (7914) (publicado el 25 de mayo de 2022): 594–602. Bibcode :2022Natur.606..594Z. doi :10.1038/s41586-022-04753-7. PMC 9373927 . PMID 35614224.
- ^ Lee S, Karki R, Wang Y, Nguyen LN, Kalathur RC, Kanneganti TD (septiembre de 2021). "AIM2 forma un complejo con pirina y ZBP1 para impulsar la PANoptosis y la defensa del huésped". Nature . 597 (7876): 415–419. Bibcode :2021Natur.597..415L. doi :10.1038/s41586-021-03875-8. PMC 8603942 . PMID 34471287.
- ^ Upton JW, Kaiser WJ, Mocarski ES (octubre de 2019). "Complejos DAI/ZBP1/DLM-1 con RIP3 para mediar la necrosis programada inducida por virus que es el objetivo del citomegalovirus murino vIRA". Cell Host & Microbe . 26 (4) (publicado el 9 de octubre de 2019): 564. doi :10.1016/j.chom.2019.09.004. PMID 31600504.
- ^ Koehler H, Cotsmire S, Zhang T, Balachandran S, Upton JW, Langland J, et al. (agosto de 2021). "El virus vaccinia E3 impide la detección de ARN-Z para bloquear la necroptosis dependiente de ZBP1". Cell Host & Microbe . 29 (8): 1266–1276.e5. doi :10.1016/j.chom.2021.05.009. PMC 9333947 . PMID 34192517.
- ^ Steain M, Baker MO, Pham CL, Shanmugam N, Gambin Y, Sierecki E, et al. (julio de 2020). "El virus de la varicela zóster codifica un señuelo viral RHIM para inhibir la muerte celular". PLOS Pathogens . 16 (7): e1008473. doi : 10.1371/journal.ppat.1008473 . PMC 7375649 . PMID 32649716.
- ^ Daniels BP, Kofman SB, Smith JR, Norris GT, Snyder AG, Kolb JP, et al. (enero de 2019). "El sensor de nucleótidos ZBP1 y la quinasa RIPK3 inducen la enzima IRG1 para promover un estado metabólico antiviral en las neuronas". Inmunidad . 50 (1): 64–76.e4. doi :10.1016/j.immuni.2018.11.017. PMC 6342485 . PMID 30635240.
- ^ Banoth B, Tuladhar S, Karki R, Sharma BR, Briard B, Kesavardhana S, et al. (diciembre de 2020). "ZBP1 promueve la activación del inflamasoma inducida por hongos y la piroptosis, apoptosis y necroptosis (PANoptosis)". The Journal of Biological Chemistry . 295 (52): 18276–18283. doi : 10.1074/jbc.RA120.015924 . PMC 7939383 . PMID 33109609.
- ^ Rathinam VA, Fitzgerald KA (marzo de 2011). "Detección inmunitaria innata de virus de ADN". Virología . 411 (2): 153–162. doi :10.1016/j.virol.2011.02.003. PMC 3070751 . PMID 21334037.
- ^ Ha SC, Kim D, Hwang HY, Rich A, Kim YG, Kim KK (diciembre de 2008). "La estructura cristalina del segundo dominio de unión a Z-ADN de DAI humano (ZBP1) en complejo con Z-ADN revela un modo de unión inusual a Z-ADN". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 105 (52): 20671–20676. Bibcode :2008PNAS..10520671H. doi : 10.1073/pnas.0810463106 . PMC 2634953 . PMID 19095800.
- ^ Kuriakose T, Man SM, Malireddi RK, Karki R, Kesavardhana S, Place DE, et al. (Agosto de 2016). "ZBP1/DAI es un sensor innato del virus de la influenza que desencadena el inflamasoma NLRP3 y las vías de muerte celular programada". Inmunología científica . 1 (2): aag2045. doi : 10.1126/sciimmunol.aag2045. PMC 5131924 . PMID 27917412.
- ^ ab Kesavardhana S, Kuriakose T, Guy CS, Samir P, Malireddi RK, Mishra A, et al. (agosto de 2017). "La ubiquitinación de ZBP1/DAI y la detección de vRNP de influenza activan la muerte celular programada". The Journal of Experimental Medicine . 214 (8): 2217–2229. doi :10.1084/jem.20170550. PMC 5551577 . PMID 28634194.
- ^ Zhang T, Yin C, Boyd DF, Quarato G, Ingram JP, Shubina M, et al. (marzo de 2020). "Los ARN-Z del virus de la influenza inducen necrosis mediada por ZBP1". Cell . 180 (6): 1115–1129.e13. doi :10.1016/j.cell.2020.02.050. PMC 7153753 . PMID 32200799.
- ^ Kuriakose T, Zheng M, Neale G, Kanneganti TD (febrero de 2018). "IRF1 es un regulador transcripcional de ZBP1 que promueve la activación del inflamasoma NLRP3 y la muerte celular durante la infección por el virus de la influenza". Journal of Immunology . 200 (4): 1489–1495. doi :10.4049/jimmunol.1701538. PMC 6483084 . PMID 29321274.
Lectura adicional
- Ha SC, Van Quyen D, Hwang HY, Oh DB, Brown BA, Lee SM, et al. (febrero de 2006). "Caracterización bioquímica y estudio cristalográfico preliminar de rayos X de los dominios de ZBP1 humana unidos a Z-ADN levógiro". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteínas y proteómica . 1764 (2): 320–323. doi :10.1016/j.bbapap.2005.12.012. PMID 16448869.
- Schwartz T, Behlke J, Lowenhaupt K, Heinemann U, Rich A (septiembre de 2001). "La estructura del complejo DLM-1-Z-DNA revela una familia conservada de proteínas de unión a Z-DNA". Nature Structural Biology . 8 (9): 761–765. doi : 10.1038/nsb0901-761 . PMID 11524677. S2CID 22313681.
- Schwartz T, Rould MA, Lowenhaupt K, Herbert A, Rich A (junio de 1999). "Estructura cristalina del dominio Zalpha de la enzima de edición humana ADAR1 unida al ADN-Z zurdo". Science . 284 (5421): 1841–1845. doi :10.1126/science.284.5421.1841. PMID 10364558.